Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CXCR5P32302 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CXCR5P32302 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXCR5P32302 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCR5P32302 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms