Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHA3P29320 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHA3P29320 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA3P29320 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHA3P29320 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms