Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST1P01037 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST1P01037 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST1P01037 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CST1P01037 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST1P01037 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST1P01037 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST1P01037 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST1P01037 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST1P01037 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST1P01037 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST1P01037 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST1P01037 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CST1P01037 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST1P01037 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST1P01037 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST1P01037 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST1P01037 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST1P01037 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST1P01037 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST1P01037 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST1P01037 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST1P01037 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST1P01037 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST1P01037 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST1P01037 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CST1P01037 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST1P01037 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CST1P01037 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CST1P01037 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CST1P01037 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST1P01037 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST1P01037 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST1P01037 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CST1P01037 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CST1P01037 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST1P01037 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST1P01037 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST1P01037 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST1P01037 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST1P01037 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST1P01037 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST1P01037 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST1P01037 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST1P01037 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST1P01037 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST1P01037 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST1P01037 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST1P01037 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CST1P01037 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CST1P01037 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CST1P01037 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CST1P01037 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CST1P01037 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CST1P01037 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CST1P01037 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CST1P01037 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CST1P01037 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CST1P01037 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CST1P01037 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CST1P01037 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CST1P01037 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CST1P01037 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CST1P01037 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms