Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CST1P01037 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CST1P01037 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CST1P01037 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CST1P01037 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CST1P01037 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CST1P01037 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CST1P01037 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CST1P01037 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CST1P01037 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CST1P01037 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CST1P01037 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CST1P01037 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CST1P01037 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CST1P01037 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CST1P01037 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CST1P01037 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CST1P01037 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CST1P01037 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CST1P01037 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CST1P01037 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CST1P01037 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CST1P01037 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CST1P01037 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CST1P01037 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CST1P01037 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST1P01037 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CST1P01037 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CST1P01037 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CST1P01037 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CST1P01037 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CST1P01037 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CST1P01037 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CST1P01037 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CST1P01037 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CST1P01037 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CST1P01037 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CST1P01037 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CST1P01037 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CST1P01037 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CST1P01037 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CST1P01037 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST1P01037 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST1P01037 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST1P01037 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CST1P01037 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST1P01037 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST1P01037 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST1P01037 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CST1P01037 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST1P01037 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CST1P01037 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CST1P01037 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST1P01037 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CST1P01037 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CST1P01037 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CST1P01037 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CST1P01037 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CST1P01037 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CST1P01037 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CST1P01037 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CST1P01037 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CST1P01037 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CST1P01037 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CST1P01037 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CST1P01037 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CST1P01037 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CST1P01037 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CST1P01037 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CST1P01037 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CST1P01037 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CST1P01037 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CST1P01037 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CST1P01037 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CST1P01037 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CST1P01037 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CST1P01037 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CST1P01037 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CST1P01037 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CST1P01037 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CST1P01037 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CST1P01037 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CST1P01037 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CST1P01037 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CST1P01037 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CST1P01037 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CST1P01037 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CST1P01037 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CST1P01037 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CST1P01037 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CST1P01037 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CST1P01037 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CST1P01037 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CST1P01037 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CST1P01037 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CST1P01037 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CST1P01037 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CST1P01037 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CST1P01037 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CST1P01037 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms