Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-17■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 214.3□□□□□ -0.127e-14■■■■■ 54.4
RBFOX2O43251 TAP2-203ENST00000464100 849 ntTSL 29.26□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 54.3
RBFOX2O43251 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 214.83□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 57.17□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 37.17□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 36.67□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.59□□□□□ -1.993e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.67□□□□□ -2.143e-8■■■■■ 54.1
RBFOX2O43251 MYO9B-211ENST00000597881 432 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-16■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 318.5■□□□□ 0.551e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 316.74■□□□□ 0.271e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 414.31□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 311.69□□□□□ -0.541e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 311.6□□□□□ -0.551e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 310.72□□□□□ -0.691e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 310.72□□□□□ -0.691e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 57.21□□□□□ -1.261e-15■■■■■ 54
RBFOX2O43251 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 53.7
RBFOX2O43251 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 53.7
RBFOX2O43251 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 39.62□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 53.7
RBFOX2O43251 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 27.64□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 53.7
RBFOX2O43251 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 45.84□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 53.7
RBFOX2O43251 ATXN1-204ENST00000473388 1569 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.564e-11■■■■■ 53.5
RBFOX2O43251 ERBB3-215ENST00000550828 266 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.693e-30■■■■■ 53.4
RBFOX2O43251 TSC2-217ENST00000561695 555 ntTSL 212.47□□□□□ -0.413e-15■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ARHGEF28-206ENST00000504003 539 ntTSL 47.47□□□□□ -1.211e-29■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.28e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.068e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-204ENST00000571721 813 ntTSL 514.12□□□□□ -0.158e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.28e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-209ENST00000575659 742 ntTSL 312.66□□□□□ -0.388e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.568e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 511.47□□□□□ -0.578e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-205ENST00000572105 1168 ntTSL 510.94□□□□□ -0.668e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.788e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-202ENST00000570382 471 ntTSL 410.16□□□□□ -0.788e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-211ENST00000575994 856 ntTSL 39.9□□□□□ -0.828e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 59.78□□□□□ -0.848e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-203ENST00000571691 761 ntTSL 39.77□□□□□ -0.858e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 ACTG1-213ENST00000576214 1024 ntTSL 59.46□□□□□ -0.98e-16■■■■■ 53.3
RBFOX2O43251 CDH24-203ENST00000485922 2006 ntTSL 217.21■□□□□ 0.351e-15■■■■■ 53
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RBFOX2O43251 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 52.8
RBFOX2O43251 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 52.8
RBFOX2O43251 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-6■■■■■ 52.8
RBFOX2O43251 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-15■■■■■ 52.7
RBFOX2O43251 WDR77-203ENST00000459665 637 ntTSL 39.42□□□□□ -0.92e-15■■■■■ 52.7
RBFOX2O43251 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 59.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 52.2
RBFOX2O43251 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 512.11□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 211.18□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-208ENST00000433289 1618 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)7.87□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 52
RBFOX2O43251 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-15■■■■■ 52
RBFOX2O43251 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-15■■■■■ 52
RBFOX2O43251 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.74□□□□□ -0.214e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.4□□□□□ -0.424e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-216ENST00000641805 2945 nt11.86□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-212ENST00000641446 2820 nt11.41□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-215ENST00000641759 2454 nt10.47□□□□□ -0.734e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.744e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt9.75□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 51.9
RBFOX2O43251 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 48.18□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 51.8
RBFOX2O43251 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 34.97□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 51.8
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