RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426568.5

VGLL4-210, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-210ENST00000426568 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.03■■■■■ 4.48
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VGLL4-210ENST00000426568 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.33■■■□□ 2.93
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VGLL4-210ENST00000426568 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
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VGLL4-210ENST00000426568 SMARCA2P51531 1590 aa32.98■■■□□ 2.87
VGLL4-210ENST00000426568 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
VGLL4-210ENST00000426568 NCAPD3P42695 1498 aa32.89■■■□□ 2.86
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VGLL4-210ENST00000426568 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.98■■■□□ 2.71
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VGLL4-210ENST00000426568 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.52■■■□□ 2.64
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VGLL4-210ENST00000426568 WDR62O43379 1518 aa31.3■■■□□ 2.6
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VGLL4-210ENST00000426568 TOPBP1Q92547 1522 aa31.16■■■□□ 2.58
VGLL4-210ENST00000426568 ABCC8Q09428 1581 aa31.14■■■□□ 2.58
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VGLL4-210ENST00000426568 SYNJ1O43426 1573 aa30.99■■■□□ 2.55
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VGLL4-210ENST00000426568 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.64■■■□□ 2.5
VGLL4-210ENST00000426568 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
VGLL4-210ENST00000426568 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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VGLL4-210ENST00000426568 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.483e-7■■■■■ 36.6
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VGLL4-210ENST00000426568 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.48■■■□□ 2.47
VGLL4-210ENST00000426568 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.43■■■□□ 2.46
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VGLL4-210ENST00000426568 GRIN2AQ12879 1464 aa30■■■□□ 2.39
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VGLL4-210ENST00000426568 OSCARQ8IYS5 282 aa29.89■■■□□ 2.38
VGLL4-210ENST00000426568 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.89■■■□□ 2.38
VGLL4-210ENST00000426568 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
VGLL4-210ENST00000426568 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
VGLL4-210ENST00000426568 CEP170Q5SW79 1584 aa29.86■■■□□ 2.37
VGLL4-210ENST00000426568 NUP160Q12769 1436 aa29.86■■■□□ 2.37
VGLL4-210ENST00000426568 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.83■■■□□ 2.37
VGLL4-210ENST00000426568 KIF21BO75037 1637 aa29.77■■■□□ 2.36
VGLL4-210ENST00000426568 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.65■■■□□ 2.34
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