Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCYO14598 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCYO14598 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCYO14598 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VCYO14598 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCYO14598 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCYO14598 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCYO14598 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VCYO14598 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCYO14598 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCYO14598 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VCYO14598 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VCYO14598 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VCYO14598 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VCYO14598 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VCYO14598 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VCYO14598 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VCYO14598 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VCYO14598 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VCYO14598 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VCYO14598 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VCYO14598 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VCYO14598 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VCYO14598 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VCYO14598 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VCYO14598 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VCYO14598 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VCYO14598 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VCYO14598 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VCYO14598 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VCYO14598 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VCYO14598 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VCYO14598 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VCYO14598 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VCYO14598 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VCYO14598 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VCYO14598 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VCYO14598 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VCYO14598 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VCYO14598 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VCYO14598 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VCYO14598 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VCYO14598 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VCYO14598 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VCYO14598 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VCYO14598 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VCYO14598 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VCYO14598 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VCYO14598 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VCYO14598 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VCYO14598 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VCYO14598 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VCYO14598 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VCYO14598 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VCYO14598 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VCYO14598 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VCYO14598 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VCYO14598 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms