Protein–RNA interactions for Protein: O00194

RAB27B, Ras-related protein Rab-27B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27BO00194 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27BO00194 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB27BO00194 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB27BO00194 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB27BO00194 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms