Protein–RNA interactions for Protein: O00194

RAB27B, Ras-related protein Rab-27B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27BO00194 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB27BO00194 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB27BO00194 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB27BO00194 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB27BO00194 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB27BO00194 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB27BO00194 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB27BO00194 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27BO00194 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB27BO00194 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB27BO00194 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27BO00194 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB27BO00194 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB27BO00194 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB27BO00194 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB27BO00194 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB27BO00194 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB27BO00194 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB27BO00194 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27BO00194 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27BO00194 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB27BO00194 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB27BO00194 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27BO00194 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB27BO00194 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB27BO00194 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB27BO00194 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27BO00194 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB27BO00194 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB27BO00194 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB27BO00194 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27BO00194 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27BO00194 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB27BO00194 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB27BO00194 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27BO00194 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27BO00194 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27BO00194 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB27BO00194 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB27BO00194 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB27BO00194 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB27BO00194 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27BO00194 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27BO00194 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27BO00194 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27BO00194 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27BO00194 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27BO00194 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27BO00194 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB27BO00194 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB27BO00194 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB27BO00194 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB27BO00194 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB27BO00194 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB27BO00194 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27BO00194 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB27BO00194 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27BO00194 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27BO00194 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27BO00194 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27BO00194 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB27BO00194 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB27BO00194 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB27BO00194 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB27BO00194 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB27BO00194 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB27BO00194 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB27BO00194 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB27BO00194 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB27BO00194 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB27BO00194 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB27BO00194 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB27BO00194 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB27BO00194 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB27BO00194 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB27BO00194 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB27BO00194 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB27BO00194 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27BO00194 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27BO00194 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27BO00194 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27BO00194 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27BO00194 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB27BO00194 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB27BO00194 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27BO00194 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB27BO00194 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms