Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms