Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.412e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 NSMAF-204ENST00000518159 582 ntTSL 35.01□□□□□ -1.612e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.872e-8■□□□□ 11
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NIPBLQ6KC79 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 10.8
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NIPBLQ6KC79 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 10.8
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NIPBLQ6KC79 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -09e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.799e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.849e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.019e-7■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 320.9■□□□□ 0.948e-19■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.428e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.258e-19■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 516.41■□□□□ 0.228e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.218e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 516.02■□□□□ 0.158e-10■□□□□ 10.7
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NIPBLQ6KC79 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.28e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 513.68□□□□□ -0.228e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.248e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 213.53□□□□□ -0.248e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.278e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.428e-10■□□□□ 10.7
NIPBLQ6KC79 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.478e-10■□□□□ 10.7
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