RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484488.5

PSMA7-205, Transcript of proteasome subunit alpha 7, humanhuman

TSL 3

Gene PSMA7, Length 1,023 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA7-205ENST00000484488 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.98
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PSMA7-205ENST00000484488 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.58■■■■■ 5.53
PSMA7-205ENST00000484488 NACADO15069 1562 aa49.41■■■■■ 5.5
PSMA7-205ENST00000484488 MYO15BQ96JP2 1530 aa49■■■■■ 5.43
PSMA7-205ENST00000484488 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.86■■■■■ 5.41
PSMA7-205ENST00000484488 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
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PSMA7-205ENST00000484488 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.58■■■■■ 5.37
PSMA7-205ENST00000484488 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.12■■■■■ 5.29
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PSMA7-205ENST00000484488 SCRIBQ14160 1630 aa47.71■■■■■ 5.23
PSMA7-205ENST00000484488 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.65■■■■■ 5.22
PSMA7-205ENST00000484488 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
PSMA7-205ENST00000484488 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.79■■■■■ 5.08
PSMA7-205ENST00000484488 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.5■■■■■ 5.03
PSMA7-205ENST00000484488 SMARCA4P51532 1647 aa45.66■■■■■ 4.9
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PSMA7-205ENST00000484488 SMARCA2P51531 1590 aa45.45■■■■■ 4.87
PSMA7-205ENST00000484488 HMGXB3Q12766 1538 aa45.36■■■■■ 4.85
PSMA7-205ENST00000484488 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.28■■■■■ 4.84
PSMA7-205ENST00000484488 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
PSMA7-205ENST00000484488 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
PSMA7-205ENST00000484488 WIZO95785 1651 aa44.66■■■■■ 4.74
PSMA7-205ENST00000484488 ERCC6Q03468 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
PSMA7-205ENST00000484488 NESP48681 1621 aa44.55■■■■■ 4.72
PSMA7-205ENST00000484488 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.49■■■■■ 4.71
PSMA7-205ENST00000484488 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
PSMA7-205ENST00000484488 CUX2O14529 1486 aa44.39■■■■■ 4.7
PSMA7-205ENST00000484488 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
PSMA7-205ENST00000484488 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
PSMA7-205ENST00000484488 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.15■■■■■ 4.66
PSMA7-205ENST00000484488 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.13■■■■■ 4.65
PSMA7-205ENST00000484488 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.09■■■■■ 4.65
PSMA7-205ENST00000484488 CFTRP13569 1480 aa43.82■■■■■ 4.6
PSMA7-205ENST00000484488 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.72■■■■■ 4.59
PSMA7-205ENST00000484488 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.67■■■■■ 4.58
PSMA7-205ENST00000484488 WDR62O43379 1518 aa43.67■■■■■ 4.58
PSMA7-205ENST00000484488 PRDM2Q13029 1718 aa43.65■■■■■ 4.58
PSMA7-205ENST00000484488 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.64■■■■■ 4.58
PSMA7-205ENST00000484488 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.57■■■■■ 4.57
PSMA7-205ENST00000484488 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.49■■■■■ 4.55
PSMA7-205ENST00000484488 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
PSMA7-205ENST00000484488 TOPBP1Q92547 1522 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMA7-205ENST00000484488 ABCC8Q09428 1581 aa42.9■■■■■ 4.46
PSMA7-205ENST00000484488 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.87■■■■■ 4.45
PSMA7-205ENST00000484488 IFT140Q96RY7 1462 aa42.77■■■■■ 4.44
PSMA7-205ENST00000484488 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PSMA7-205ENST00000484488 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
PSMA7-205ENST00000484488 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PSMA7-205ENST00000484488 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
PSMA7-205ENST00000484488 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
PSMA7-205ENST00000484488 CUX1P39880 1505 aa42.4■■■■■ 4.38
PSMA7-205ENST00000484488 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
PSMA7-205ENST00000484488 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.27■■■■■ 4.36
PSMA7-205ENST00000484488 WDR97A6NE52 1622 aa42.27■■■■■ 4.36
PSMA7-205ENST00000484488 OSCARQ8IYS5 282 aa42.26■■■■■ 4.36
PSMA7-205ENST00000484488 SOGA1O94964 1423 aa42.24■■■■■ 4.35
PSMA7-205ENST00000484488 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.353e-7■■■■■ 30.9
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PSMA7-205ENST00000484488 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
PSMA7-205ENST00000484488 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42■■■■■ 4.31
PSMA7-205ENST00000484488 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
PSMA7-205ENST00000484488 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.92■■■■■ 4.3
PSMA7-205ENST00000484488 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.9■■■■■ 4.3
PSMA7-205ENST00000484488 PBRM1Q86U86 1689 aa41.89■■■■■ 4.3
PSMA7-205ENST00000484488 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.3
PSMA7-205ENST00000484488 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.3
PSMA7-205ENST00000484488 GRIN2BQ13224 1484 aa41.88■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.87■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
PSMA7-205ENST00000484488 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.8■■■■■ 4.28
PSMA7-205ENST00000484488 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
PSMA7-205ENST00000484488 TRIM41Q8WV44 630 aa41.72■■■■■ 4.27
PSMA7-205ENST00000484488 SYNJ2O15056 1496 aa41.7■■■■■ 4.27
PSMA7-205ENST00000484488 FBLN2P98095 1184 aa41.69■■■■■ 4.26
PSMA7-205ENST00000484488 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.61■■■■■ 4.25
PSMA7-205ENST00000484488 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
PSMA7-205ENST00000484488 ADAMTS12P58397 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
PSMA7-205ENST00000484488 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.43■■■■■ 4.22
PSMA7-205ENST00000484488 GRIN2AQ12879 1464 aa41.37■■■■■ 4.21
PSMA7-205ENST00000484488 ARAP1Q96P48 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
PSMA7-205ENST00000484488 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.3■■■■■ 4.2
PSMA7-205ENST00000484488 NUP160Q12769 1436 aa41.22■■■■■ 4.19
PSMA7-205ENST00000484488 CEP170Q5SW79 1584 aa41.21■■■■■ 4.19
PSMA7-205ENST00000484488 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.18■■■■■ 4.18
PSMA7-205ENST00000484488 SHROOM2Q13796 1616 aa41.06■■■■■ 4.16
PSMA7-205ENST00000484488 KIF27Q86VH2 1401 aa41.05■■■■■ 4.16
PSMA7-205ENST00000484488 CUL7Q14999 1698 aa41■■■■■ 4.15
PSMA7-205ENST00000484488 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.92■■■■■ 4.14
PSMA7-205ENST00000484488 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.91■■■■■ 4.14
PSMA7-205ENST00000484488 IGF1RP08069 1367 aa40.9■■■■■ 4.14
PSMA7-205ENST00000484488 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
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