Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV1-8P0DP01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-8P0DP01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV1-8P0DP01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV1-8P0DP01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV1-8P0DP01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV1-8P0DP01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms