Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 521.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC22A18-210ENST00000492567 684 ntTSL 221.28■■□□□ 12e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 221.15■□□□□ 0.988e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AP000347.1-207ENST00000432595 601 ntTSL 321.12■□□□□ 0.978e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-213ENST00000636212 1053 ntTSL 520.84■□□□□ 0.938e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.938e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-220ENST00000637450 868 ntTSL 320.37■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.818e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-210ENST00000635747 1181 ntTSL 520.04■□□□□ 0.88e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.88e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.798e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PKN3-202ENST00000483521 597 ntTSL 519.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.788e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.758e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PKN3-203ENST00000485301 752 ntTSL 519.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CORO7-220ENST00000573245 443 ntTSL 319.12■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.657e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 IL10RB-202ENST00000422891 786 ntTSL 319.08■□□□□ 0.657e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZNF775-202ENST00000490973 675 ntTSL 219.06■□□□□ 0.648e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 219.04■□□□□ 0.648e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 318.98■□□□□ 0.638e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 IGHMBP2-204ENST00000539064 2346 ntTSL 218.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-209ENST00000551800 773 ntTSL 518.93■□□□□ 0.628e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP1R3E-206ENST00000560913 932 ntTSL 218.91■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-208ENST00000551706 984 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.68e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TNFRSF8-205ENST00000514649 2412 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-218ENST00000637223 652 ntTSL 518.58■□□□□ 0.578e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CORO7-203ENST00000570645 501 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CORO7-225ENST00000575038 832 ntTSL 518.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.548e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SSH1-208ENST00000548522 602 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SF3B4-202ENST00000457312 826 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RADIL-206ENST00000473130 2108 ntTSL 218.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RIPK1-203ENST00000479389 1481 ntTSL 317.9■□□□□ 0.468e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP1R3E-209ENST00000561437 690 ntTSL 217.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 317.8■□□□□ 0.448e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.426e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ISL2-203ENST00000558656 1446 ntTSL 517.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.388e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 217.44■□□□□ 0.388e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PIF1-207ENST00000559872 459 ntTSL 317.43■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.378e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.366e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.366e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 USP20-204ENST00000472108 1811 ntTSL 217.12■□□□□ 0.336e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 316.99■□□□□ 0.316e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MED28-204ENST00000506409 347 ntTSL 216.99■□□□□ 0.318e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 516.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SPG7-218ENST00000568205 463 ntTSL 216.9■□□□□ 0.36e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP2R1A-203ENST00000454220 1233 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.286e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-203ENST00000317251 1910 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ORC5-202ENST00000422497 2043 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 316.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.226e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ODF2-214ENST00000469582 1054 ntTSL 316.38■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.216e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.26e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-207ENST00000597687 859 ntTSL 316.28■□□□□ 0.26e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CORO7-206ENST00000571052 578 ntTSL 416.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP1R3E-207ENST00000561178 1594 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-219ENST00000552202 1290 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RADIL-202ENST00000445392 5669 ntTSL 515.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NXF1-204ENST00000527064 572 ntTSL 215.7■□□□□ 0.16e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 515.64■□□□□ 0.096e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 215.59■□□□□ 0.098e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MBOAT7-209ENST00000464098 493 ntTSL 215.32■□□□□ 0.048e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 HEY1-204ENST00000518733 761 ntTSL 315.3■□□□□ 0.048e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.036e-13■■■■■ 155.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1342.4 ms