RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.15■■■■■ 4.18
CLN6-218ENST00000637223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.37■■■■□ 3.41
CLN6-218ENST00000637223 ABCC9O60706 1549 aa36.33■■■■□ 3.41
CLN6-218ENST00000637223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.79■■■■□ 3.16
CLN6-218ENST00000637223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.38■■■■□ 3.09
CLN6-218ENST00000637223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CLN6-218ENST00000637223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.17■■■■□ 3.06
CLN6-218ENST00000637223 NACADO15069 1562 aa34.16■■■■□ 3.06
CLN6-218ENST00000637223 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.02■■■■□ 3.04
CLN6-218ENST00000637223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.01■■■■□ 3.04
CLN6-218ENST00000637223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.77■■■■□ 3
CLN6-218ENST00000637223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.36■■■□□ 2.93
CLN6-218ENST00000637223 SCRIBQ14160 1630 aa33.32■■■□□ 2.92
CLN6-218ENST00000637223 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.21■■■□□ 2.91
CLN6-218ENST00000637223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.82■■■□□ 2.84
CLN6-218ENST00000637223 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.77■■■□□ 2.84
CLN6-218ENST00000637223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.72■■■□□ 2.83
CLN6-218ENST00000637223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
CLN6-218ENST00000637223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.45■■■□□ 2.79
CLN6-218ENST00000637223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CLN6-218ENST00000637223 SMARCA4P51532 1647 aa31.85■■■□□ 2.69
CLN6-218ENST00000637223 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.75■■■□□ 2.67
CLN6-218ENST00000637223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.64■■■□□ 2.66
CLN6-218ENST00000637223 SMARCA2P51531 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
CLN6-218ENST00000637223 NCAPD3P42695 1498 aa31.54■■■□□ 2.64
CLN6-218ENST00000637223 CUX2O14529 1486 aa31.53■■■□□ 2.64
CLN6-218ENST00000637223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
CLN6-218ENST00000637223 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.5■■■□□ 2.63
CLN6-218ENST00000637223 ERCC6Q03468 1493 aa31.4■■■□□ 2.62
CLN6-218ENST00000637223 WIZO95785 1651 aa31.4■■■□□ 2.62
CLN6-218ENST00000637223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CLN6-218ENST00000637223 HMGXB3Q12766 1538 aa31.39■■■□□ 2.62
CLN6-218ENST00000637223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CLN6-218ENST00000637223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CLN6-218ENST00000637223 NESP48681 1621 aa30.99■■■□□ 2.55
CLN6-218ENST00000637223 TRIM41Q8WV44 630 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN6-218ENST00000637223 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.75■■■□□ 2.51
CLN6-218ENST00000637223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CLN6-218ENST00000637223 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.67■■■□□ 2.5
CLN6-218ENST00000637223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.63■■■□□ 2.49
CLN6-218ENST00000637223 CFTRP13569 1480 aa30.53■■■□□ 2.48
CLN6-218ENST00000637223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.49■■■□□ 2.47
CLN6-218ENST00000637223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.48■■■□□ 2.47
CLN6-218ENST00000637223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.32■■■□□ 2.44
CLN6-218ENST00000637223 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.25■■■□□ 2.43
CLN6-218ENST00000637223 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.24■■■□□ 2.43
CLN6-218ENST00000637223 PRDM2Q13029 1718 aa30.21■■■□□ 2.43
CLN6-218ENST00000637223 WDR62O43379 1518 aa30.16■■■□□ 2.42
CLN6-218ENST00000637223 OSCARQ8IYS5 282 aa30.08■■■□□ 2.41
CLN6-218ENST00000637223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CLN6-218ENST00000637223 TOPBP1Q92547 1522 aa29.86■■■□□ 2.37
CLN6-218ENST00000637223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.84■■■□□ 2.37
CLN6-218ENST00000637223 ABCC8Q09428 1581 aa29.83■■■□□ 2.37
CLN6-218ENST00000637223 CUX1P39880 1505 aa29.76■■■□□ 2.36
CLN6-218ENST00000637223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.341e-9■■■■■ 46
CLN6-218ENST00000637223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.68■■■□□ 2.34
CLN6-218ENST00000637223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.68■■■□□ 2.34
CLN6-218ENST00000637223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.68■■■□□ 2.34
CLN6-218ENST00000637223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
CLN6-218ENST00000637223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.62■■■□□ 2.33
CLN6-218ENST00000637223 IFT140Q96RY7 1462 aa29.6■■■□□ 2.33
CLN6-218ENST00000637223 SYNJ1O43426 1573 aa29.6■■■□□ 2.33
CLN6-218ENST00000637223 TOP2BQ02880 1626 aa29.55■■■□□ 2.32
CLN6-218ENST00000637223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.55■■■□□ 2.32
CLN6-218ENST00000637223 SOGA1O94964 1423 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN6-218ENST00000637223 ARHGEF11O15085 1522 aa29.52■■■□□ 2.32
CLN6-218ENST00000637223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.52■■■□□ 2.32
CLN6-218ENST00000637223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CLN6-218ENST00000637223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CLN6-218ENST00000637223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN6-218ENST00000637223 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CLN6-218ENST00000637223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CLN6-218ENST00000637223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.292e-7■■■■□ 23.4
CLN6-218ENST00000637223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CLN6-218ENST00000637223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.32■■■□□ 2.28
CLN6-218ENST00000637223 WDR97A6NE52 1622 aa29.28■■■□□ 2.28
CLN6-218ENST00000637223 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.18■■■□□ 2.26
CLN6-218ENST00000637223 ARAP1Q96P48 1450 aa29.18■■■□□ 2.26
CLN6-218ENST00000637223 FBLN2P98095 1184 aa29.17■■■□□ 2.26
CLN6-218ENST00000637223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
CLN6-218ENST00000637223 GRIN2BQ13224 1484 aa29.14■■■□□ 2.26
CLN6-218ENST00000637223 CHD1O14646 1710 aa29.13■■■□□ 2.25
CLN6-218ENST00000637223 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.09■■■□□ 2.25
CLN6-218ENST00000637223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.09■■■□□ 2.25
CLN6-218ENST00000637223 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CLN6-218ENST00000637223 KIF27Q86VH2 1401 aa29.04■■■□□ 2.24
CLN6-218ENST00000637223 PBRM1Q86U86 1689 aa29.04■■■□□ 2.24
CLN6-218ENST00000637223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CLN6-218ENST00000637223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.96■■■□□ 2.23
CLN6-218ENST00000637223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.91■■■□□ 2.22
CLN6-218ENST00000637223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CLN6-218ENST00000637223 SYNJ2O15056 1496 aa28.91■■■□□ 2.22
CLN6-218ENST00000637223 IGF1RP08069 1367 aa28.9■■■□□ 2.22
CLN6-218ENST00000637223 ADAMTS12P58397 1594 aa28.88■■■□□ 2.21
CLN6-218ENST00000637223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
CLN6-218ENST00000637223 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.77■■■□□ 2.2
CLN6-218ENST00000637223 GRIN2AQ12879 1464 aa28.76■■■□□ 2.19
CLN6-218ENST00000637223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.74■■■□□ 2.19
CLN6-218ENST00000637223 CUL7Q14999 1698 aa28.74■■■□□ 2.19
CLN6-218ENST00000637223 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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