Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 POLG-222ENST00000637264 3153 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-8■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 216.23■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 220.67■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 NUMA1-229ENST00000545721 2796 ntTSL 515.59■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MAP2K1-202ENST00000425818 1338 ntTSL 527.76■■■□□ 2.036e-10■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 LTBP4-231ENST00000602251 671 ntTSL 224.75■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.296e-10■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.286e-10■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.366e-10■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.156e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 MCM2-205ENST00000473785 684 ntTSL 218.5■□□□□ 0.556e-8■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 DDB1-202ENST00000414411 1904 ntTSL 211.67□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 OPN3-205ENST00000478849 880 ntTSL 332.17■■■□□ 2.742e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 OPN3-204ENST00000469376 1961 ntTSL 1 (best)29.52■■■□□ 2.322e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)28.36■■■□□ 2.132e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.562e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 OPN3-203ENST00000463155 806 ntTSL 39.43□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 20.9
FMR1Q06787 PML-219ENST00000569161 675 ntTSL 321.77■■□□□ 1.084e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 PML-218ENST00000567606 2042 ntTSL 1 (best)21.42■■□□□ 1.024e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 PML-213ENST00000565239 783 ntTSL 320.91■□□□□ 0.944e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.298e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 NSD1-203ENST00000375350 442 ntTSL 39.03□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KDM5C-201ENST00000349663 548 ntTSL 424.54■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KDM5C-206ENST00000428012 766 ntTSL 318.98■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.398e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.578e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 210.96□□□□□ -0.656e-12■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 UPF1-210ENST00000600689 3084 ntTSL 221.03■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.386e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.443e-8■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.313e-8■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KRTCAP3-204ENST00000453171 665 ntTSL 314.52□□□□□ -0.093e-8■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 517.76■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.572e-7■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 SEPT5-212ENST00000470814 2353 ntTSL 522.59■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 20.8
FMR1Q06787 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 316.96■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.847e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 317.5■□□□□ 0.393e-10■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.93e-9■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 DNMT1-212ENST00000587197 809 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 SND1-204ENST00000465900 630 ntTSL 47.59□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.729e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.149e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.28e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 RACGAP1-212ENST00000548320 554 ntTSL 422.31■■□□□ 1.165e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 RACGAP1-213ENST00000548598 582 ntTSL 421.52■■□□□ 1.045e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 RACGAP1-227ENST00000552310 932 ntTSL 319.73■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 RACGAP1-208ENST00000547061 581 ntTSL 38.03□□□□□ -1.125e-7■■■■□ 20.7
FMR1Q06787 MCM3AP-210ENST00000496607 4075 ntTSL 210.94□□□□□ -0.669e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 513.22□□□□□ -0.298e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DROSHA-215ENST00000512076 1124 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NOL6-205ENST00000464829 1829 ntTSL 218.49■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NOL6-201ENST00000297990 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NOL6-202ENST00000353159 3411 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 219.04■□□□□ 0.643e-7■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 341.17■■■■■ 4.189e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.319e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PDCD2-211ENST00000544336 1164 ntTSL 1 (best)35.72■■■■□ 3.319e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 IPO9-203ENST00000464348 838 ntTSL 533■■■□□ 2.879e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 332.92■■■□□ 2.869e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DMTF1-230ENST00000580710 635 ntTSL 530.59■■■□□ 2.499e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-210ENST00000574895 558 ntTSL 429.25■■■□□ 2.279e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 329.09■■■□□ 2.259e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 528.79■■■□□ 2.22e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NSD1-212ENST00000512992 470 ntTSL 528.56■■■□□ 2.169e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 328.03■■■□□ 2.089e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TNKS1BP1-205ENST00000530920 957 ntTSL 327.52■■■□□ 29e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.942e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TNRC18-201ENST00000328270 1220 ntTSL 526.92■■□□□ 1.99e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-211ENST00000575106 837 ntTSL 426.08■■□□□ 1.779e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-215ENST00000490204 774 ntTSL 526.04■■□□□ 1.762e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NSD1-215ENST00000602285 1414 ntTSL 1 (best)25.78■■□□□ 1.729e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-204ENST00000570857 554 ntTSL 325.62■■□□□ 1.699e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.699e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.672e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SMG8-204ENST00000580498 785 ntTSL 525.18■■□□□ 1.629e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.579e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.479e-6■■■■□ 20.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 86.8 ms