RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512992.1

NSD1-212, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene NSD1, Length 470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1-212ENST00000512992 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.51■■■■■ 6.48
NSD1-212ENST00000512992 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.63■■■■■ 5.54
NSD1-212ENST00000512992 ABCC9O60706 1549 aa49.29■■■■■ 5.48
NSD1-212ENST00000512992 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.12■■■■■ 5.13
NSD1-212ENST00000512992 NACADO15069 1562 aa46.9■■■■■ 5.1
NSD1-212ENST00000512992 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.74■■■■■ 5.07
NSD1-212ENST00000512992 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.41■■■■■ 5.02
NSD1-212ENST00000512992 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
NSD1-212ENST00000512992 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.98■■■■■ 4.95
NSD1-212ENST00000512992 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.97■■■■■ 4.95
NSD1-212ENST00000512992 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.94■■■■■ 4.95
NSD1-212ENST00000512992 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.92■■■■■ 4.94
NSD1-212ENST00000512992 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.67■■■■■ 4.9
NSD1-212ENST00000512992 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.21■■■■■ 4.83
NSD1-212ENST00000512992 SCRIBQ14160 1630 aa45.19■■■■■ 4.83
NSD1-212ENST00000512992 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
NSD1-212ENST00000512992 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.55■■■■■ 4.72
NSD1-212ENST00000512992 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.41■■■■■ 4.7
NSD1-212ENST00000512992 NCAPD3P42695 1498 aa43.32■■■■■ 4.52
NSD1-212ENST00000512992 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.19■■■■■ 4.51
NSD1-212ENST00000512992 SMARCA4P51532 1647 aa43.19■■■■■ 4.5
NSD1-212ENST00000512992 SMARCA2P51531 1590 aa43.1■■■■■ 4.49
NSD1-212ENST00000512992 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
NSD1-212ENST00000512992 HMGXB3Q12766 1538 aa42.97■■■■■ 4.47
NSD1-212ENST00000512992 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.82■■■■■ 4.44
NSD1-212ENST00000512992 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
NSD1-212ENST00000512992 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.73■■■■■ 4.43
NSD1-212ENST00000512992 ERCC6Q03468 1493 aa42.57■■■■■ 4.41
NSD1-212ENST00000512992 NESP48681 1621 aa42.42■■■■■ 4.38
NSD1-212ENST00000512992 CUX2O14529 1486 aa42.42■■■■■ 4.38
NSD1-212ENST00000512992 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.25■■■■■ 4.35
NSD1-212ENST00000512992 WIZO95785 1651 aa42.21■■■■■ 4.35
NSD1-212ENST00000512992 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.05■■■■■ 4.32
NSD1-212ENST00000512992 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.04■■■■■ 4.32
NSD1-212ENST00000512992 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
NSD1-212ENST00000512992 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.01■■■■■ 4.32
NSD1-212ENST00000512992 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
NSD1-212ENST00000512992 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.86■■■■■ 4.29
NSD1-212ENST00000512992 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
NSD1-212ENST00000512992 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.6■■■■■ 4.25
NSD1-212ENST00000512992 CFTRP13569 1480 aa41.59■■■■■ 4.25
NSD1-212ENST00000512992 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.51■■■■■ 4.24
NSD1-212ENST00000512992 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.49■■■■■ 4.23
NSD1-212ENST00000512992 WDR62O43379 1518 aa41.47■■■■■ 4.23
NSD1-212ENST00000512992 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.29■■■■■ 4.2
NSD1-212ENST00000512992 PRDM2Q13029 1718 aa41.11■■■■■ 4.17
NSD1-212ENST00000512992 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
NSD1-212ENST00000512992 ABCC8Q09428 1581 aa40.76■■■■■ 4.12
NSD1-212ENST00000512992 TOPBP1Q92547 1522 aa40.73■■■■■ 4.11
NSD1-212ENST00000512992 IFT140Q96RY7 1462 aa40.69■■■■■ 4.1
NSD1-212ENST00000512992 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.61■■■■■ 4.09
NSD1-212ENST00000512992 OSCARQ8IYS5 282 aa40.6■■■■■ 4.09
NSD1-212ENST00000512992 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
NSD1-212ENST00000512992 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
NSD1-212ENST00000512992 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
NSD1-212ENST00000512992 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
NSD1-212ENST00000512992 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
NSD1-212ENST00000512992 TRIM41Q8WV44 630 aa40.28■■■■■ 4.04
NSD1-212ENST00000512992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.037e-6■■□□□ 12.2
NSD1-212ENST00000512992 SOGA1O94964 1423 aa40.21■■■■■ 4.03
NSD1-212ENST00000512992 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.17■■■■■ 4.02
NSD1-212ENST00000512992 CUX1P39880 1505 aa40.13■■■■■ 4.01
NSD1-212ENST00000512992 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.13■■■■■ 4.01
NSD1-212ENST00000512992 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
NSD1-212ENST00000512992 WDR97A6NE52 1622 aa40.01■■■■■ 4
NSD1-212ENST00000512992 FBLN2P98095 1184 aa39.94■■■■□ 3.98
NSD1-212ENST00000512992 CHD1O14646 1710 aa39.91■■■■□ 3.98
NSD1-212ENST00000512992 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.9■■■■□ 3.98
NSD1-212ENST00000512992 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.9■■■■□ 3.98
NSD1-212ENST00000512992 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.9■■■■□ 3.98
NSD1-212ENST00000512992 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
NSD1-212ENST00000512992 GRIN2BQ13224 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
NSD1-212ENST00000512992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.81■■■■□ 3.96
NSD1-212ENST00000512992 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
NSD1-212ENST00000512992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
NSD1-212ENST00000512992 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.72■■■■□ 3.95
NSD1-212ENST00000512992 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.7■■■■□ 3.95
NSD1-212ENST00000512992 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
NSD1-212ENST00000512992 SYNJ2O15056 1496 aa39.63■■■■□ 3.94
NSD1-212ENST00000512992 TOP2BQ02880 1626 aa39.6■■■■□ 3.93
NSD1-212ENST00000512992 PBRM1Q86U86 1689 aa39.58■■■■□ 3.93
NSD1-212ENST00000512992 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.58■■■■□ 3.93
NSD1-212ENST00000512992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.58■■■■□ 3.93
NSD1-212ENST00000512992 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.58■■■■□ 3.93
NSD1-212ENST00000512992 SYNJ1O43426 1573 aa39.56■■■■□ 3.92
NSD1-212ENST00000512992 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.52■■■■□ 3.92
NSD1-212ENST00000512992 ARAP1Q96P48 1450 aa39.45■■■■□ 3.91
NSD1-212ENST00000512992 GRIN2AQ12879 1464 aa39.27■■■■□ 3.88
NSD1-212ENST00000512992 ADAMTS12P58397 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
NSD1-212ENST00000512992 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
NSD1-212ENST00000512992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.23■■■■□ 3.87
NSD1-212ENST00000512992 NUP160Q12769 1436 aa39.14■■■■□ 3.86
NSD1-212ENST00000512992 CEP170Q5SW79 1584 aa39.07■■■■□ 3.84
NSD1-212ENST00000512992 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
NSD1-212ENST00000512992 KIF27Q86VH2 1401 aa38.89■■■■□ 3.82
NSD1-212ENST00000512992 SHROOM2Q13796 1616 aa38.89■■■■□ 3.82
NSD1-212ENST00000512992 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.88■■■■□ 3.81
NSD1-212ENST00000512992 IGF1RP08069 1367 aa38.84■■■■□ 3.81
NSD1-212ENST00000512992 JPH4Q96JJ6 628 aa38.81■■■■□ 3.8
NSD1-212ENST00000512992 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
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