RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.57■■■■□ 3.93
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PPP1CC-201ENST00000335007 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
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PPP1CC-201ENST00000335007 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.66■■■□□ 2.98
PPP1CC-201ENST00000335007 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.51■■■□□ 2.96
PPP1CC-201ENST00000335007 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.35■■■□□ 2.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.34■■■□□ 2.93
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PPP1CC-201ENST00000335007 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.45■■■□□ 2.78
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PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC9O60706 1549 aa31.99■■■□□ 2.71
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PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM41Q8WV44 630 aa31.65■■■□□ 2.66
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PPP1CC-201ENST00000335007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.5■■■□□ 2.63
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PPP1CC-201ENST00000335007 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
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PPP1CC-201ENST00000335007 NEUROD1Q13562 356 aa31.12■■■□□ 2.57
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PPP1CC-201ENST00000335007 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP1CC-201ENST00000335007 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.76■■■□□ 2.51
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PPP1CC-201ENST00000335007 WIZO95785 1651 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CC-201ENST00000335007 NACADO15069 1562 aa30.66■■■□□ 2.5
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PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP162Q5TB80 1403 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP1CC-201ENST00000335007 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP1CC-201ENST00000335007 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC8Q09428 1581 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP1CC-201ENST00000335007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PPP1CC-201ENST00000335007 EEA1Q15075 1411 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP1CC-201ENST00000335007 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
PPP1CC-201ENST00000335007 SOGA1O94964 1423 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP1CC-201ENST00000335007 MIER1Q8N108 512 aa30.12■■■□□ 2.41
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PPP1CC-201ENST00000335007 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.96■■■□□ 2.39
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PPP1CC-201ENST00000335007 CLIP1P30622 1438 aa29.73■■■□□ 2.35
PPP1CC-201ENST00000335007 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP1CC-201ENST00000335007 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PPP1CC-201ENST00000335007 APLP2Q06481 763 aa29.61■■■□□ 2.33
PPP1CC-201ENST00000335007 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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PPP1CC-201ENST00000335007 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP1CC-201ENST00000335007 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP1CC-201ENST00000335007 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP1CC-201ENST00000335007 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.31■■■□□ 2.28
PPP1CC-201ENST00000335007 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP1CC-201ENST00000335007 CUX2O14529 1486 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP1CC-201ENST00000335007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP1CC-201ENST00000335007 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PPP1CC-201ENST00000335007 ARAP1Q96P48 1450 aa29.16■■■□□ 2.26
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PPP1CC-201ENST00000335007 TOP2BQ02880 1626 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP1CC-201ENST00000335007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP1CC-201ENST00000335007 PRXQ9BXM0 1461 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP1CC-201ENST00000335007 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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PPP1CC-201ENST00000335007 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.96■■■□□ 2.23
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PPP1CC-201ENST00000335007 BCANQ96GW7 911 aa28.86■■■□□ 2.21
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PPP1CC-201ENST00000335007 NEFLP07196 543 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.75■■■□□ 2.19
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR97A6NE52 1622 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGAEP38570 1179 aa28.72■■■□□ 2.19
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF27Q86VH2 1401 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K1Q13233 1512 aa28.69■■■□□ 2.18
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