RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478849.1

OPN3-205, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 3

Gene OPN3, Length 880 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-205ENST00000478849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.57■■■■■ 7.45
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OPN3-205ENST00000478849 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.32■■■■■ 6.45
OPN3-205ENST00000478849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.89■■■■■ 6.06
OPN3-205ENST00000478849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.74■■■■■ 6.03
OPN3-205ENST00000478849 NACADO15069 1562 aa52.43■■■■■ 5.98
OPN3-205ENST00000478849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.25■■■■■ 5.95
OPN3-205ENST00000478849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.96■■■■■ 5.91
OPN3-205ENST00000478849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.67■■■■■ 5.86
OPN3-205ENST00000478849 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.57■■■■■ 5.85
OPN3-205ENST00000478849 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.39■■■■■ 5.82
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OPN3-205ENST00000478849 SCRIBQ14160 1630 aa50.47■■■■■ 5.67
OPN3-205ENST00000478849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.35■■■■■ 5.65
OPN3-205ENST00000478849 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.3■■■■■ 5.64
OPN3-205ENST00000478849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
OPN3-205ENST00000478849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.65■■■■■ 5.38
OPN3-205ENST00000478849 NCAPD3P42695 1498 aa48.45■■■■■ 5.35
OPN3-205ENST00000478849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.27■■■■■ 5.32
OPN3-205ENST00000478849 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
OPN3-205ENST00000478849 CUX2O14529 1486 aa48.18■■■■■ 5.3
OPN3-205ENST00000478849 SMARCA4P51532 1647 aa48.09■■■■■ 5.29
OPN3-205ENST00000478849 SMARCA2P51531 1590 aa48.06■■■■■ 5.28
OPN3-205ENST00000478849 HMGXB3Q12766 1538 aa48.02■■■■■ 5.28
OPN3-205ENST00000478849 NESP48681 1621 aa47.85■■■■■ 5.25
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OPN3-205ENST00000478849 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.46■■■■■ 5.19
OPN3-205ENST00000478849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.37■■■■■ 5.17
OPN3-205ENST00000478849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
OPN3-205ENST00000478849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.15■■■■■ 5.14
OPN3-205ENST00000478849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.15■■■■■ 5.14
OPN3-205ENST00000478849 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.98■■■■■ 5.11
OPN3-205ENST00000478849 WIZO95785 1651 aa46.86■■■■■ 5.09
OPN3-205ENST00000478849 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.76■■■■■ 5.08
OPN3-205ENST00000478849 WDR62O43379 1518 aa46.64■■■■■ 5.06
OPN3-205ENST00000478849 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.51■■■■■ 5.04
OPN3-205ENST00000478849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.44■■■■■ 5.03
OPN3-205ENST00000478849 TRIM41Q8WV44 630 aa46.41■■■■■ 5.02
OPN3-205ENST00000478849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
OPN3-205ENST00000478849 CFTRP13569 1480 aa46.35■■■■■ 5.01
OPN3-205ENST00000478849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
OPN3-205ENST00000478849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
OPN3-205ENST00000478849 OSCARQ8IYS5 282 aa46■■■■■ 4.95
OPN3-205ENST00000478849 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.75■■■■■ 4.91
OPN3-205ENST00000478849 PRDM2Q13029 1718 aa45.74■■■■■ 4.91
OPN3-205ENST00000478849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
OPN3-205ENST00000478849 IFT140Q96RY7 1462 aa45.59■■■■■ 4.89
OPN3-205ENST00000478849 TOPBP1Q92547 1522 aa45.52■■■■■ 4.88
OPN3-205ENST00000478849 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.38■■■■■ 4.86
OPN3-205ENST00000478849 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.38■■■■■ 4.86
OPN3-205ENST00000478849 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.38■■■■■ 4.86
OPN3-205ENST00000478849 ABCC8Q09428 1581 aa45.36■■■■■ 4.85
OPN3-205ENST00000478849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
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OPN3-205ENST00000478849 ARHGEF11O15085 1522 aa45.22■■■■■ 4.83
OPN3-205ENST00000478849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.16■■■■■ 4.821e-12■■■■□ 20.3
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OPN3-205ENST00000478849 CHD1O14646 1710 aa44.98■■■■■ 4.79
OPN3-205ENST00000478849 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.98■■■■■ 4.79
OPN3-205ENST00000478849 FBLN2P98095 1184 aa44.96■■■■■ 4.79
OPN3-205ENST00000478849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.91■■■■■ 4.78
OPN3-205ENST00000478849 SOGA1O94964 1423 aa44.84■■■■■ 4.77
OPN3-205ENST00000478849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
OPN3-205ENST00000478849 ARAP1Q96P48 1450 aa44.76■■■■■ 4.76
OPN3-205ENST00000478849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.71■■■■■ 4.75
OPN3-205ENST00000478849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.65■■■■■ 4.74
OPN3-205ENST00000478849 CUX1P39880 1505 aa44.6■■■■■ 4.73
OPN3-205ENST00000478849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
OPN3-205ENST00000478849 WDR97A6NE52 1622 aa44.57■■■■■ 4.72
OPN3-205ENST00000478849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
OPN3-205ENST00000478849 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.49■■■■■ 4.71
OPN3-205ENST00000478849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
OPN3-205ENST00000478849 GRIN2BQ13224 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
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OPN3-205ENST00000478849 SYNJ2O15056 1496 aa44.36■■■■■ 4.69
OPN3-205ENST00000478849 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.27■■■■■ 4.68
OPN3-205ENST00000478849 PBRM1Q86U86 1689 aa44.21■■■■■ 4.67
OPN3-205ENST00000478849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.15■■■■■ 4.66
OPN3-205ENST00000478849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
OPN3-205ENST00000478849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.1■■■■■ 4.65
OPN3-205ENST00000478849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.92■■■■■ 4.62
OPN3-205ENST00000478849 GRIN2AQ12879 1464 aa43.89■■■■■ 4.62
OPN3-205ENST00000478849 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.82■■■■■ 4.61
OPN3-205ENST00000478849 ADAMTS12P58397 1594 aa43.8■■■■■ 4.6
OPN3-205ENST00000478849 NUP160Q12769 1436 aa43.76■■■■■ 4.6
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OPN3-205ENST00000478849 CEP170Q5SW79 1584 aa43.75■■■■■ 4.59
OPN3-205ENST00000478849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.74■■■■■ 4.59
OPN3-205ENST00000478849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.69■■■■■ 4.58
OPN3-205ENST00000478849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.58■■■■■ 4.57
OPN3-205ENST00000478849 SHROOM2Q13796 1616 aa43.57■■■■■ 4.57
OPN3-205ENST00000478849 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
OPN3-205ENST00000478849 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
OPN3-205ENST00000478849 JPH4Q96JJ6 628 aa43.37■■■■■ 4.53
OPN3-205ENST00000478849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.18■■■■■ 4.5
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