RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.63■■■■■ 6.5
OPN3-204ENST00000469376 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.75■■■■■ 5.39
OPN3-204ENST00000469376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
OPN3-204ENST00000469376 ABCC9O60706 1549 aa46.6■■■■■ 5.05
OPN3-204ENST00000469376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.14■■■■■ 4.98
OPN3-204ENST00000469376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.01■■■■■ 4.96
OPN3-204ENST00000469376 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.68■■■■■ 4.9
OPN3-204ENST00000469376 NACADO15069 1562 aa45.56■■■■■ 4.88
OPN3-204ENST00000469376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.39■■■■■ 4.86
OPN3-204ENST00000469376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.29■■■■■ 4.84
OPN3-204ENST00000469376 SCRIBQ14160 1630 aa44.74■■■■■ 4.75
OPN3-204ENST00000469376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
OPN3-204ENST00000469376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.29■■■■■ 4.68
OPN3-204ENST00000469376 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.91■■■■■ 4.62
OPN3-204ENST00000469376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
OPN3-204ENST00000469376 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.54■■■■■ 4.56
OPN3-204ENST00000469376 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.26■■■■■ 4.52
OPN3-204ENST00000469376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
OPN3-204ENST00000469376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
OPN3-204ENST00000469376 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.94■■■■■ 4.46
OPN3-204ENST00000469376 SMARCA4P51532 1647 aa42.86■■■■■ 4.45
OPN3-204ENST00000469376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
OPN3-204ENST00000469376 WIZO95785 1651 aa42.54■■■■■ 4.4
OPN3-204ENST00000469376 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.37■■■■■ 4.37
OPN3-204ENST00000469376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.32■■■■■ 4.37
OPN3-204ENST00000469376 HRCP23327 699 aa42.28■■■■■ 4.36
OPN3-204ENST00000469376 SMARCA2P51531 1590 aa42.28■■■■■ 4.36
OPN3-204ENST00000469376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.15■■■■■ 4.34
OPN3-204ENST00000469376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
OPN3-204ENST00000469376 NCAPD3P42695 1498 aa42.06■■■■■ 4.32
OPN3-204ENST00000469376 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
OPN3-204ENST00000469376 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.03■■■■■ 4.32
OPN3-204ENST00000469376 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.02■■■■■ 4.32
OPN3-204ENST00000469376 HMGXB3Q12766 1538 aa41.94■■■■■ 4.3
OPN3-204ENST00000469376 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.69■■■■■ 4.26
OPN3-204ENST00000469376 TRIM41Q8WV44 630 aa41.68■■■■■ 4.26
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.68■■■■■ 4.26
OPN3-204ENST00000469376 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
OPN3-204ENST00000469376 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
OPN3-204ENST00000469376 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
OPN3-204ENST00000469376 CFTRP13569 1480 aa40.97■■■■■ 4.15
OPN3-204ENST00000469376 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.95■■■■■ 4.15
OPN3-204ENST00000469376 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
OPN3-204ENST00000469376 NESP48681 1621 aa40.73■■■■■ 4.11
OPN3-204ENST00000469376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.71■■■■■ 4.11
OPN3-204ENST00000469376 PRDM2Q13029 1718 aa40.66■■■■■ 4.1
OPN3-204ENST00000469376 ABCC8Q09428 1581 aa40.6■■■■■ 4.09
OPN3-204ENST00000469376 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.51■■■■■ 4.08
OPN3-204ENST00000469376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.48■■■■■ 4.07
OPN3-204ENST00000469376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.07
OPN3-204ENST00000469376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.44■■■■■ 4.06
OPN3-204ENST00000469376 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.28■■■■■ 4.04
OPN3-204ENST00000469376 EEA1Q15075 1411 aa40.27■■■■■ 4.04
OPN3-204ENST00000469376 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.04
OPN3-204ENST00000469376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.21■■■■■ 4.03
OPN3-204ENST00000469376 CUX1P39880 1505 aa40.19■■■■■ 4.02
OPN3-204ENST00000469376 TOP2BQ02880 1626 aa40.16■■■■■ 4.02
OPN3-204ENST00000469376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.12■■■■■ 4.01
OPN3-204ENST00000469376 SOGA1O94964 1423 aa40.09■■■■■ 4.01
OPN3-204ENST00000469376 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.08■■■■■ 4.01
OPN3-204ENST00000469376 CEP162Q5TB80 1403 aa40.03■■■■■ 4
OPN3-204ENST00000469376 ERCC6Q03468 1493 aa40.03■■■■■ 4
OPN3-204ENST00000469376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.01■■■■□ 3.99
OPN3-204ENST00000469376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
OPN3-204ENST00000469376 TOPBP1Q92547 1522 aa39.97■■■■□ 3.99
OPN3-204ENST00000469376 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.95■■■■□ 3.99
OPN3-204ENST00000469376 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.93■■■■□ 3.98
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA3Q08378 1498 aa39.85■■■■□ 3.97
OPN3-204ENST00000469376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
OPN3-204ENST00000469376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.84■■■■□ 3.97
OPN3-204ENST00000469376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
OPN3-204ENST00000469376 WDR62O43379 1518 aa39.72■■■■□ 3.95
OPN3-204ENST00000469376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
OPN3-204ENST00000469376 KIF21BO75037 1637 aa39.67■■■■□ 3.94
OPN3-204ENST00000469376 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
OPN3-204ENST00000469376 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
OPN3-204ENST00000469376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.6■■■■□ 3.93
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
OPN3-204ENST00000469376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 CUX2O14529 1486 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
OPN3-204ENST00000469376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
OPN3-204ENST00000469376 WDR97A6NE52 1622 aa39.37■■■■□ 3.89
OPN3-204ENST00000469376 IFT140Q96RY7 1462 aa39.36■■■■□ 3.89
OPN3-204ENST00000469376 CLIP1P30622 1438 aa39.3■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
OPN3-204ENST00000469376 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.2■■■■□ 3.87
OPN3-204ENST00000469376 IGF1RP08069 1367 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.17■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
OPN3-204ENST00000469376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.851e-12■■■■□ 20.3
OPN3-204ENST00000469376 PRXQ9BXM0 1461 aa39.06■■■■□ 3.84
OPN3-204ENST00000469376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
OPN3-204ENST00000469376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.99■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 GRIN2BQ13224 1484 aa38.96■■■■□ 3.83
OPN3-204ENST00000469376 PBRM1Q86U86 1689 aa38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms