RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425818.2

MAP2K1-202, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene MAP2K1, Length 1,338 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K1-202ENST00000425818 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.47■■■■■ 6.31
MAP2K1-202ENST00000425818 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.61■■■■■ 5.37
MAP2K1-202ENST00000425818 ABCC9O60706 1549 aa47.75■■■■■ 5.23
MAP2K1-202ENST00000425818 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.85■■■■■ 4.93
MAP2K1-202ENST00000425818 NACADO15069 1562 aa45.73■■■■■ 4.91
MAP2K1-202ENST00000425818 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.55■■■■■ 4.88
MAP2K1-202ENST00000425818 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.36■■■■■ 4.85
MAP2K1-202ENST00000425818 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
MAP2K1-202ENST00000425818 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.07■■■■■ 4.81
MAP2K1-202ENST00000425818 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
MAP2K1-202ENST00000425818 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.53■■■■■ 4.72
MAP2K1-202ENST00000425818 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.47■■■■■ 4.71
MAP2K1-202ENST00000425818 SCRIBQ14160 1630 aa44.3■■■■■ 4.68
MAP2K1-202ENST00000425818 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.01■■■■■ 4.64
MAP2K1-202ENST00000425818 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.98■■■■■ 4.63
MAP2K1-202ENST00000425818 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
MAP2K1-202ENST00000425818 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.22■■■■■ 4.51
MAP2K1-202ENST00000425818 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.94■■■■■ 4.46
MAP2K1-202ENST00000425818 SMARCA4P51532 1647 aa42.36■■■■■ 4.37
MAP2K1-202ENST00000425818 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
MAP2K1-202ENST00000425818 NCAPD3P42695 1498 aa42.16■■■■■ 4.34
MAP2K1-202ENST00000425818 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.16■■■■■ 4.34
MAP2K1-202ENST00000425818 SMARCA2P51531 1590 aa42.11■■■■■ 4.33
MAP2K1-202ENST00000425818 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.98■■■■■ 4.31
MAP2K1-202ENST00000425818 HMGXB3Q12766 1538 aa41.97■■■■■ 4.31
MAP2K1-202ENST00000425818 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.95■■■■■ 4.31
MAP2K1-202ENST00000425818 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
MAP2K1-202ENST00000425818 WIZO95785 1651 aa41.55■■■■■ 4.24
MAP2K1-202ENST00000425818 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
MAP2K1-202ENST00000425818 NESP48681 1621 aa41.25■■■■■ 4.19
MAP2K1-202ENST00000425818 ERCC6Q03468 1493 aa41.17■■■■■ 4.18
MAP2K1-202ENST00000425818 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.13■■■■■ 4.17
MAP2K1-202ENST00000425818 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
MAP2K1-202ENST00000425818 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.91■■■■■ 4.14
MAP2K1-202ENST00000425818 CUX2O14529 1486 aa40.85■■■■■ 4.13
MAP2K1-202ENST00000425818 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.83■■■■■ 4.13
MAP2K1-202ENST00000425818 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.82■■■■■ 4.13
MAP2K1-202ENST00000425818 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
MAP2K1-202ENST00000425818 CFTRP13569 1480 aa40.63■■■■■ 4.1
MAP2K1-202ENST00000425818 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.57■■■■■ 4.08
MAP2K1-202ENST00000425818 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.47■■■■■ 4.07
MAP2K1-202ENST00000425818 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.44■■■■■ 4.06
MAP2K1-202ENST00000425818 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.44■■■■■ 4.06
MAP2K1-202ENST00000425818 PRDM2Q13029 1718 aa40.43■■■■■ 4.06
MAP2K1-202ENST00000425818 WDR62O43379 1518 aa40.34■■■■■ 4.05
MAP2K1-202ENST00000425818 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
MAP2K1-202ENST00000425818 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
MAP2K1-202ENST00000425818 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.85■■■■□ 3.97
MAP2K1-202ENST00000425818 TOPBP1Q92547 1522 aa39.8■■■■□ 3.96
MAP2K1-202ENST00000425818 ABCC8Q09428 1581 aa39.77■■■■□ 3.96
MAP2K1-202ENST00000425818 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.75■■■■□ 3.95
MAP2K1-202ENST00000425818 IFT140Q96RY7 1462 aa39.6■■■■□ 3.93
MAP2K1-202ENST00000425818 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
MAP2K1-202ENST00000425818 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
MAP2K1-202ENST00000425818 CUX1P39880 1505 aa39.41■■■■□ 3.9
MAP2K1-202ENST00000425818 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
MAP2K1-202ENST00000425818 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
MAP2K1-202ENST00000425818 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.31■■■■□ 3.88
MAP2K1-202ENST00000425818 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.26■■■■□ 3.88
MAP2K1-202ENST00000425818 SOGA1O94964 1423 aa39.24■■■■□ 3.87
MAP2K1-202ENST00000425818 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.865e-6■■■□□ 15.7
MAP2K1-202ENST00000425818 WDR97A6NE52 1622 aa39.09■■■■□ 3.85
MAP2K1-202ENST00000425818 OSCARQ8IYS5 282 aa39.05■■■■□ 3.84
MAP2K1-202ENST00000425818 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
MAP2K1-202ENST00000425818 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.84
MAP2K1-202ENST00000425818 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.03■■■■□ 3.84
MAP2K1-202ENST00000425818 TOP2BQ02880 1626 aa39.01■■■■□ 3.84
MAP2K1-202ENST00000425818 SYNJ1O43426 1573 aa39■■■■□ 3.83
MAP2K1-202ENST00000425818 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.91■■■■□ 3.82
MAP2K1-202ENST00000425818 CHD1O14646 1710 aa38.91■■■■□ 3.82
MAP2K1-202ENST00000425818 GRIN2BQ13224 1484 aa38.84■■■■□ 3.81
MAP2K1-202ENST00000425818 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.84■■■■□ 3.81
MAP2K1-202ENST00000425818 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.82■■■■□ 3.81
MAP2K1-202ENST00000425818 PBRM1Q86U86 1689 aa38.82■■■■□ 3.81
MAP2K1-202ENST00000425818 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.8■■■■□ 3.8
MAP2K1-202ENST00000425818 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
MAP2K1-202ENST00000425818 FBLN2P98095 1184 aa38.73■■■■□ 3.79
MAP2K1-202ENST00000425818 SYNJ2O15056 1496 aa38.62■■■■□ 3.77
MAP2K1-202ENST00000425818 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
MAP2K1-202ENST00000425818 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.54■■■■□ 3.76
MAP2K1-202ENST00000425818 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.54■■■■□ 3.76
MAP2K1-202ENST00000425818 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.54■■■■□ 3.76
MAP2K1-202ENST00000425818 ARHGEF11O15085 1522 aa38.49■■■■□ 3.75
MAP2K1-202ENST00000425818 ADAMTS12P58397 1594 aa38.47■■■■□ 3.75
MAP2K1-202ENST00000425818 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.46■■■■□ 3.75
MAP2K1-202ENST00000425818 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.44■■■■□ 3.74
MAP2K1-202ENST00000425818 TRIM41Q8WV44 630 aa38.43■■■■□ 3.74
MAP2K1-202ENST00000425818 GRIN2AQ12879 1464 aa38.35■■■■□ 3.73
MAP2K1-202ENST00000425818 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.34■■■■□ 3.73
MAP2K1-202ENST00000425818 KIF27Q86VH2 1401 aa38.24■■■■□ 3.71
MAP2K1-202ENST00000425818 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
MAP2K1-202ENST00000425818 NUP160Q12769 1436 aa38.18■■■■□ 3.7
MAP2K1-202ENST00000425818 ARAP1Q96P48 1450 aa38.15■■■■□ 3.7
MAP2K1-202ENST00000425818 IGF1RP08069 1367 aa38.09■■■■□ 3.69
MAP2K1-202ENST00000425818 CUL7Q14999 1698 aa38.09■■■■□ 3.69
MAP2K1-202ENST00000425818 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.09■■■■□ 3.69
MAP2K1-202ENST00000425818 SHROOM2Q13796 1616 aa37.97■■■■□ 3.67
MAP2K1-202ENST00000425818 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.91■■■■□ 3.66
MAP2K1-202ENST00000425818 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.89■■■■□ 3.66
MAP2K1-202ENST00000425818 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms