RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490673.5

OPN3-206, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-206ENST00000490673 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.81■■■■■ 6.52
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OPN3-206ENST00000490673 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
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OPN3-206ENST00000490673 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.45■■■■■ 5.03
OPN3-206ENST00000490673 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.27■■■■■ 5
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OPN3-206ENST00000490673 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.38■■■■■ 4.86
OPN3-206ENST00000490673 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.29■■■■■ 4.84
OPN3-206ENST00000490673 SCRIBQ14160 1630 aa45.16■■■■■ 4.82
OPN3-206ENST00000490673 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.12■■■■■ 4.81
OPN3-206ENST00000490673 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
OPN3-206ENST00000490673 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.36■■■■■ 4.69
OPN3-206ENST00000490673 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
OPN3-206ENST00000490673 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.67■■■■■ 4.58
OPN3-206ENST00000490673 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.52■■■■■ 4.56
OPN3-206ENST00000490673 SMARCA4P51532 1647 aa43.21■■■■■ 4.51
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OPN3-206ENST00000490673 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.04■■■■■ 4.48
OPN3-206ENST00000490673 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.01■■■■■ 4.48
OPN3-206ENST00000490673 NCAPD3P42695 1498 aa42.96■■■■■ 4.47
OPN3-206ENST00000490673 SMARCA2P51531 1590 aa42.87■■■■■ 4.45
OPN3-206ENST00000490673 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.8■■■■■ 4.44
OPN3-206ENST00000490673 HMGXB3Q12766 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
OPN3-206ENST00000490673 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
OPN3-206ENST00000490673 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
OPN3-206ENST00000490673 WIZO95785 1651 aa42.54■■■■■ 4.4
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OPN3-206ENST00000490673 NESP48681 1621 aa41.89■■■■■ 4.3
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OPN3-206ENST00000490673 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.74■■■■■ 4.27
OPN3-206ENST00000490673 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.7■■■■■ 4.27
OPN3-206ENST00000490673 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.66■■■■■ 4.26
OPN3-206ENST00000490673 ERCC6Q03468 1493 aa41.58■■■■■ 4.25
OPN3-206ENST00000490673 CFTRP13569 1480 aa41.51■■■■■ 4.23
OPN3-206ENST00000490673 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.48■■■■■ 4.23
OPN3-206ENST00000490673 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.27■■■■■ 4.2
OPN3-206ENST00000490673 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.21■■■■■ 4.19
OPN3-206ENST00000490673 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.1■■■■■ 4.17
OPN3-206ENST00000490673 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
OPN3-206ENST00000490673 CUX2O14529 1486 aa41.05■■■■■ 4.16
OPN3-206ENST00000490673 MRC2Q9UBG0 1479 aa41■■■■■ 4.15
OPN3-206ENST00000490673 PRDM2Q13029 1718 aa40.99■■■■■ 4.15
OPN3-206ENST00000490673 WDR62O43379 1518 aa40.86■■■■■ 4.13
OPN3-206ENST00000490673 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
OPN3-206ENST00000490673 TOPBP1Q92547 1522 aa40.57■■■■■ 4.08
OPN3-206ENST00000490673 ABCC8Q09428 1581 aa40.53■■■■■ 4.08
OPN3-206ENST00000490673 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.48■■■■■ 4.07
OPN3-206ENST00000490673 CUX1P39880 1505 aa40.34■■■■■ 4.05
OPN3-206ENST00000490673 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
OPN3-206ENST00000490673 IFT140Q96RY7 1462 aa40.25■■■■■ 4.03
OPN3-206ENST00000490673 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
OPN3-206ENST00000490673 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
OPN3-206ENST00000490673 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
OPN3-206ENST00000490673 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
OPN3-206ENST00000490673 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.12■■■■■ 4.01
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OPN3-206ENST00000490673 TOP2BQ02880 1626 aa39.99■■■■□ 3.99
OPN3-206ENST00000490673 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.95■■■■□ 3.99
OPN3-206ENST00000490673 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.981e-12■■■■□ 20.3
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OPN3-206ENST00000490673 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
OPN3-206ENST00000490673 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.79■■■■□ 3.96
OPN3-206ENST00000490673 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.75■■■■□ 3.95
OPN3-206ENST00000490673 WDR97A6NE52 1622 aa39.72■■■■□ 3.95
OPN3-206ENST00000490673 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.63■■■■□ 3.93
OPN3-206ENST00000490673 GRIN2BQ13224 1484 aa39.57■■■■□ 3.93
OPN3-206ENST00000490673 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.55■■■■□ 3.92
OPN3-206ENST00000490673 OSCARQ8IYS5 282 aa39.52■■■■□ 3.92
OPN3-206ENST00000490673 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.5■■■■□ 3.91
OPN3-206ENST00000490673 FBLN2P98095 1184 aa39.44■■■■□ 3.9
OPN3-206ENST00000490673 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
OPN3-206ENST00000490673 TRIM41Q8WV44 630 aa39.4■■■■□ 3.9
OPN3-206ENST00000490673 PBRM1Q86U86 1689 aa39.4■■■■□ 3.9
OPN3-206ENST00000490673 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
OPN3-206ENST00000490673 SYNJ2O15056 1496 aa39.3■■■■□ 3.88
OPN3-206ENST00000490673 KIF27Q86VH2 1401 aa39.29■■■■□ 3.88
OPN3-206ENST00000490673 CHD1O14646 1710 aa39.29■■■■□ 3.88
OPN3-206ENST00000490673 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.28■■■■□ 3.88
OPN3-206ENST00000490673 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
OPN3-206ENST00000490673 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.17■■■■□ 3.86
OPN3-206ENST00000490673 ADAMTS12P58397 1594 aa39.15■■■■□ 3.86
OPN3-206ENST00000490673 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.09■■■■□ 3.85
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OPN3-206ENST00000490673 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.92■■■■□ 3.82
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OPN3-206ENST00000490673 CUL7Q14999 1698 aa38.88■■■■□ 3.82
OPN3-206ENST00000490673 CEP170Q5SW79 1584 aa38.85■■■■□ 3.81
OPN3-206ENST00000490673 ARHGEF11O15085 1522 aa38.79■■■■□ 3.8
OPN3-206ENST00000490673 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
OPN3-206ENST00000490673 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
OPN3-206ENST00000490673 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
OPN3-206ENST00000490673 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.68■■■■□ 3.78
OPN3-206ENST00000490673 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.67■■■■□ 3.78
OPN3-206ENST00000490673 EEA1Q15075 1411 aa38.62■■■■□ 3.77
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