Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 UBR5-210ENST00000521566 563 ntTSL 48.36□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CHORDC1-209ENST00000533724 5361 ntTSL 28.01□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CEP85-208ENST00000491670 941 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.143e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CHORDC1-211ENST00000533772 566 ntTSL 57.85□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 SSRP1-205ENST00000635721 675 ntTSL 57.8□□□□□ -1.162e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 27.57□□□□□ -1.22e-10■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 USP15-219ENST00000552997 533 ntTSL 46.98□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CD53-204ENST00000476408 756 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 46.87□□□□□ -1.313e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CD53-205ENST00000497404 917 ntTSL 55.78□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 UBR4-215ENST00000492606 314 ntTSL 35.4□□□□□ -1.541e-14■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 56.08□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-247ENST00000523921 584 ntTSL 212.35□□□□□ -0.437e-9■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 511.45□□□□□ -0.587e-9■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 221.96■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 LDHA-211ENST00000494573 1154 ntTSL 212.01□□□□□ -0.495e-15■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 NUP214-209ENST00000489260 649 ntTSL 312.15□□□□□ -0.461e-8■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-215ENST00000579780 611 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-230ENST00000584042 638 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-206ENST00000578018 567 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-228ENST00000583363 558 ntTSL 417.58■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-226ENST00000583182 709 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-233ENST00000584186 482 ntTSL 314.53□□□□□ -0.082e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-234ENST00000584525 530 ntTSL 413.89□□□□□ -0.192e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-203ENST00000577442 617 ntTSL 413.55□□□□□ -0.242e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-216ENST00000579853 714 ntTSL 412.95□□□□□ -0.342e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-210ENST00000578733 578 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-235ENST00000584592 372 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 AC018521.1-201ENST00000582262 575 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-224ENST00000582275 442 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 MCM7-212ENST00000493352 533 ntTSL 214.06□□□□□ -0.166e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 GLUL-206ENST00000462444 793 ntTSL 29.45□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 19.2
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.973e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.133e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 212.85□□□□□ -0.359e-10■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.466e-7■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.126e-7■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 UBA1-208ENST00000457753 809 ntTSL 518.05■□□□□ 0.485e-7■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-206ENST00000583741 1465 ntTSL 521.49■■□□□ 1.033e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-204ENST00000581979 1720 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 19.1
UTP3Q9NQZ2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 19
UTP3Q9NQZ2 DKC1-208ENST00000475423 587 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 19
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 517.37■□□□□ 0.374e-6■■■□□ 19
UTP3Q9NQZ2 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 226.14■■□□□ 1.789e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.529e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 524.5■■□□□ 1.519e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 514.94□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-211ENST00000599642 428 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-10■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-18■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-18■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-18■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.131e-18■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 RPL8-203ENST00000525232 1007 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.122e-28■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.157e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.757e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.025e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 18.9
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 SF3A2-205ENST00000590034 573 ntTSL 314.68□□□□□ -0.061e-13■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-206ENST00000469089 707 ntTSL 315.06■□□□□ 01e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.452e-7■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■■■□□ 18.8
UTP3Q9NQZ2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-6■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-221ENST00000533350 541 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-10■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 416.84■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.076e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 214.25□□□□□ -0.136e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.266e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.486e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.996e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-7■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-17■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-17■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-17■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.922e-17■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-17■■■□□ 18.7
UTP3Q9NQZ2 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 233.37■■■□□ 2.939e-19■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 225.31■■□□□ 1.645e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-205ENST00000546481 561 ntTSL 324.02■■□□□ 1.444e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 322.88■■□□□ 1.254e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-205ENST00000570649 612 ntTSL 222.01■■□□□ 1.112e-8■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.094e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.094e-10■■■□□ 18.6
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