RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa77.49■■■■■ 10
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LDB1-204ENST00000490751 PEG3Q9GZU2 1588 aa59.71■■■■■ 7.15
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LDB1-204ENST00000490751 CEP164Q9UPV0 1460 aa57.77■■■■■ 6.84
LDB1-204ENST00000490751 CCDC88BA6NC98 1476 aa57.68■■■■■ 6.82
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LDB1-204ENST00000490751 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa57.68■■■■■ 6.82
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LDB1-204ENST00000490751 FGD5Q6ZNL6 1462 aa56■■■■■ 6.56
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LDB1-204ENST00000490751 WDR97A6NE52 1622 aa55.71■■■■■ 6.51
LDB1-204ENST00000490751 CHD1O14646 1710 aa55.64■■■■■ 6.5
LDB1-204ENST00000490751 TRIM41Q8WV44 630 aa55.52■■■■■ 6.48
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LDB1-204ENST00000490751 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP55.43■■■■■ 6.46
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LDB1-204ENST00000490751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa55.41■■■■■ 6.46
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LDB1-204ENST00000490751 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa55.35■■■■■ 6.45
LDB1-204ENST00000490751 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa55.35■■■■■ 6.45
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LDB1-204ENST00000490751 GAPVD1Q14C86 1478 aa55.32■■■■■ 6.45
LDB1-204ENST00000490751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa55.29■■■■■ 6.44
LDB1-204ENST00000490751 ARHGEF11O15085 1522 aa55.24■■■■■ 6.43
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LDB1-204ENST00000490751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa54.73■■■■■ 6.35
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LDB1-204ENST00000490751 GRIN2AQ12879 1464 aa54.71■■■■■ 6.35
LDB1-204ENST00000490751 FHAD1B1AJZ9 1412 aa54.65■■■■■ 6.34
LDB1-204ENST00000490751 CEP170Q5SW79 1584 aa54.5■■■■■ 6.31
LDB1-204ENST00000490751 NUP160Q12769 1436 aa54.49■■■■■ 6.31
LDB1-204ENST00000490751 KIF27Q86VH2 1401 aa54.31■■■■■ 6.28
LDB1-204ENST00000490751 SHROOM2Q13796 1616 aa54.19■■■■■ 6.26
LDB1-204ENST00000490751 ERCC6L2Q5T890 1561 aa54.18■■■■■ 6.26
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LDB1-204ENST00000490751 CUL7Q14999 1698 aa54.13■■■■■ 6.26
LDB1-204ENST00000490751 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa54.03■■■■■ 6.24
LDB1-204ENST00000490751 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP53.89■■■■■ 6.22
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