Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 C1orf123-204ENST00000478839 1908 ntTSL 29.43□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SELENOF-204ENST00000467557 499 ntTSL 59□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 VPS13B-205ENST00000493587 3485 ntTSL 27.55□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DHX57-202ENST00000452978 2559 ntTSL 57.37□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NBEAL1-201ENST00000414576 2240 ntTSL 56.59□□□□□ -1.353e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NBEAL1-204ENST00000460355 3595 ntTSL 26.55□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CEP250-214ENST00000621352 607 ntTSL 36.38□□□□□ -1.393e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BLM-206ENST00000559724 4510 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.663e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARID2-208ENST00000479608 7761 ntTSL 1 (best)4.4□□□□□ -1.713e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.713e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SELENOF-206ENST00000497861 266 ntTSL 34.02□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.863e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CNOT7-203ENST00000518541 426 ntTSL 23.33□□□□□ -1.883e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.917e-9■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.827e-9■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.613e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.582e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)23.6■■□□□ 1.372e-8■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.023e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.023e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-64■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 PSMF1-204ENST00000381898 642 ntTSL 316.76■□□□□ 0.271e-64■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-64■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-64■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 PSMF1-210ENST00000484891 4030 ntTSL 28.61□□□□□ -1.031e-64■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-31■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.252e-31■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-31■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-31■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 ACTR1A-207ENST00000636707 1046 ntTSL 514.96□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.391e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 ACTR1A-202ENST00000470322 3519 ntTSL 210.45□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 26.5
PABPC4Q13310 NCAPH2-209ENST00000522304 521 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-7■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 315.4■□□□□ 0.063e-7■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.477e-8■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 217.61■□□□□ 0.417e-8■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.281e-16■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.652e-61■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-10■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 220.44■□□□□ 0.862e-10■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 SH3BP1-206ENST00000469947 2612 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-10■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 MRPS7-206ENST00000583407 864 ntTSL 312.81□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-8■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 FUNDC2-203ENST00000471528 765 ntTSL 38.47□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PET100-207ENST00000623154 1815 nt26.69■■□□□ 1.861e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 PET100-203ENST00000598540 375 ntTSL 36.43□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.223e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 TIMM29-202ENST00000588807 859 ntTSL 518.13■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-57■■■■□ 26.4
PABPC4Q13310 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-10■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 CSNK2A1-210ENST00000619801 655 ntTSL 310.33□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 EAF1-203ENST00000617675 556 ntTSL 47.46□□□□□ -1.221e-7■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-210ENST00000571613 1688 ntTSL 221.74■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-208ENST00000571043 1547 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-206ENST00000539417 1471 ntTSL 218.63■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-209ENST00000571558 1423 ntTSL 216.52■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-213ENST00000573577 1282 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-216ENST00000575599 1359 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 RPAIN-212ENST00000573126 2728 ntTSL 212.38□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 SNRNP25-207ENST00000493672 329 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-8■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 SNRNP25-204ENST00000417493 408 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-8■■■■□ 26.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 699.4 ms