RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.03■■■□□ 2.24
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NME1-NME2-201ENST00000376392 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.06■■□□□ 1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.83■■□□□ 1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.72■■□□□ 1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.71■■□□□ 1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCC9O60706 1549 aa23.65■■□□□ 1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 NACADO15069 1562 aa23.52■■□□□ 1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.3■■□□□ 1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCRIBQ14160 1630 aa23.26■■□□□ 1.31
NME1-NME2-201ENST00000376392 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.83■■□□□ 1.25
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NME1-NME2-201ENST00000376392 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.39■■□□□ 1.18
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NME1-NME2-201ENST00000376392 WIZO95785 1651 aa22.27■■□□□ 1.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
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NME1-NME2-201ENST00000376392 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMARCA2P51531 1590 aa21.93■■□□□ 1.1
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.83■■□□□ 1.09
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NME1-NME2-201ENST00000376392 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HMGXB3Q12766 1538 aa21.7■■□□□ 1.06
NME1-NME2-201ENST00000376392 NCAPD3P42695 1498 aa21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM41Q8WV44 630 aa21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-201ENST00000376392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.46■■□□□ 1.03
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCC8Q09428 1581 aa21.39■■□□□ 1.01
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NME1-NME2-201ENST00000376392 SYNJ1O43426 1573 aa21.17■□□□□ 0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 EEA1Q15075 1411 aa21.14■□□□□ 0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.13■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.13■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOP2BQ02880 1626 aa21.11■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.08■□□□□ 0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 SOGA1O94964 1423 aa20.97■□□□□ 0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 CUX1P39880 1505 aa20.95■□□□□ 0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.95■□□□□ 0.94
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NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF27Q86VH2 1401 aa20.73■□□□□ 0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.71■□□□□ 0.91
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NME1-NME2-201ENST00000376392 PBRM1Q86U86 1689 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFT140Q96RY7 1462 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARAP1Q96P48 1450 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 APLP2Q06481 763 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRIN2BQ13224 1484 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAMTS12P58397 1594 aa20.13■□□□□ 0.81
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