RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.56■■■■■ 4.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.23■■■■□ 3.39
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC9O60706 1549 aa35.48■■■■□ 3.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.09■■■■□ 3.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 NACADO15069 1562 aa34.03■■■■□ 3.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.84■■■■□ 3.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.61■■■□□ 2.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.59■■■□□ 2.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.5■■■□□ 2.95
NME1-NME2-202ENST00000393193 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.21■■■□□ 2.91
NME1-NME2-202ENST00000393193 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCRIBQ14160 1630 aa32.92■■■□□ 2.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.82■■■□□ 2.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.78■■■□□ 2.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
NME1-NME2-202ENST00000393193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.18■■■□□ 2.74
NME1-NME2-202ENST00000393193 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMARCA4P51532 1647 aa31.54■■■□□ 2.64
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCAPD3P42695 1498 aa31.41■■■□□ 2.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.39■■■□□ 2.62
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMARCA2P51531 1590 aa31.3■■■□□ 2.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.3■■■□□ 2.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMGXB3Q12766 1538 aa31.27■■■□□ 2.6
NME1-NME2-202ENST00000393193 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.26■■■□□ 2.59
NME1-NME2-202ENST00000393193 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
NME1-NME2-202ENST00000393193 WIZO95785 1651 aa30.91■■■□□ 2.54
NME1-NME2-202ENST00000393193 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
NME1-NME2-202ENST00000393193 NESP48681 1621 aa30.7■■■□□ 2.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.61■■■□□ 2.49
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERCC6Q03468 1493 aa30.5■■■□□ 2.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.41■■■□□ 2.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.41■■■□□ 2.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 CUX2O14529 1486 aa30.39■■■□□ 2.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFTRP13569 1480 aa30.25■■■□□ 2.43
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.17■■■□□ 2.42
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRDM2Q13029 1718 aa30.13■■■□□ 2.41
NME1-NME2-202ENST00000393193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.07■■■□□ 2.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.07■■■□□ 2.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR62O43379 1518 aa30.06■■■□□ 2.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.04■■■□□ 2.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.66■■■□□ 2.34
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOPBP1Q92547 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.57■■■□□ 2.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC8Q09428 1581 aa29.53■■■□□ 2.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFT140Q96RY7 1462 aa29.43■■■□□ 2.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 CUX1P39880 1505 aa29.35■■■□□ 2.29
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.23■■■□□ 2.27
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.18■■■□□ 2.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR97A6NE52 1622 aa29.15■■■□□ 2.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOGA1O94964 1423 aa29.11■■■□□ 2.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.256e-7■■■□□ 16.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.08■■■□□ 2.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOP2BQ02880 1626 aa29.03■■■□□ 2.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYNJ1O43426 1573 aa29.03■■■□□ 2.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHD1O14646 1710 aa28.97■■■□□ 2.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.96■■■□□ 2.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 OSCARQ8IYS5 282 aa28.95■■■□□ 2.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.93■■■□□ 2.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 PBRM1Q86U86 1689 aa28.89■■■□□ 2.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.85■■■□□ 2.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIN2BQ13224 1484 aa28.85■■■□□ 2.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.82■■■□□ 2.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYNJ2O15056 1496 aa28.71■■■□□ 2.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.67■■■□□ 2.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF11O15085 1522 aa28.64■■■□□ 2.18
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS12P58397 1594 aa28.63■■■□□ 2.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.6■■■□□ 2.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBLN2P98095 1184 aa28.59■■■□□ 2.17
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIN2AQ12879 1464 aa28.51■■■□□ 2.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.48■■■□□ 2.15
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP160Q12769 1436 aa28.44■■■□□ 2.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP170Q5SW79 1584 aa28.44■■■□□ 2.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARAP1Q96P48 1450 aa28.42■■■□□ 2.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM41Q8WV44 630 aa28.42■■■□□ 2.14
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF27Q86VH2 1401 aa28.35■■■□□ 2.13
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHROOM2Q13796 1616 aa28.32■■■□□ 2.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGF1RP08069 1367 aa28.32■■■□□ 2.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 CUL7Q14999 1698 aa28.31■■■□□ 2.12
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.24■■■□□ 2.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.23■■■□□ 2.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.2■■■□□ 2.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.09■■■□□ 2.09
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