Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDP2Q9P2J9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDP2Q9P2J9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDP2Q9P2J9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDP2Q9P2J9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDP2Q9P2J9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDP2Q9P2J9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDP2Q9P2J9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms