Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.623e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 323.4■■□□□ 1.343e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 423.4■■□□□ 1.343e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.023e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 518.84■□□□□ 0.613e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 417.24■□□□□ 0.353e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 212.26□□□□□ -0.453e-11■■■■■ 53.9
PCBP1Q15365 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.117e-15■■■■■ 53.7
PCBP1Q15365 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.057e-15■■■■■ 53.7
PCBP1Q15365 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-15■■■■■ 53.7
PCBP1Q15365 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-47■■■■■ 53.6
PCBP1Q15365 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-47■■■■■ 53.6
PCBP1Q15365 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 53.5
PCBP1Q15365 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-11■■■■■ 53.5
PCBP1Q15365 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.567e-36■■■■■ 53.5
PCBP1Q15365 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 53.5
PCBP1Q15365 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 53.4
PCBP1Q15365 VAT1-209ENST00000592388 478 ntTSL 58.11□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 53.4
PCBP1Q15365 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.537e-11■■■■■ 53.4
PCBP1Q15365 SLC9A1-202ENST00000374084 695 ntTSL 59.44□□□□□ -0.97e-11■■■■■ 53.4
PCBP1Q15365 UBE2Z-207ENST00000513342 4250 ntTSL 27.78□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 52.7
PCBP1Q15365 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.929e-9■■■■■ 52.3
PCBP1Q15365 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.829e-9■■■■■ 52.3
PCBP1Q15365 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.799e-9■■■■■ 52.3
PCBP1Q15365 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.79e-9■■■■■ 52.3
PCBP1Q15365 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.629e-9■■■■■ 52.3
PCBP1Q15365 CHPF2-203ENST00000482173 548 ntTSL 421.54■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-218ENST00000543076 406 ntTSL 316.31■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-213ENST00000539036 566 ntTSL 412.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-217ENST00000542256 933 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-219ENST00000624056 1842 nt8.33□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-214ENST00000539708 700 ntTSL 27.19□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-208ENST00000535624 655 ntTSL 26.76□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 MGST1-211ENST00000538857 535 ntTSL 34.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 51.9
PCBP1Q15365 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 323.4■■□□□ 1.344e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 415.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 311.45□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 410.33□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 51.6
PCBP1Q15365 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-20■■■■■ 51.5
PCBP1Q15365 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-20■■■■■ 51.5
PCBP1Q15365 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.044e-20■■■■■ 51.5
PCBP1Q15365 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 536.6■■■■□ 3.456e-11■■■■■ 51.3
PCBP1Q15365 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.616e-11■■■■■ 51.3
PCBP1Q15365 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.486e-11■■■■■ 51.3
PCBP1Q15365 CD81-206ENST00000481386 898 ntTSL 220.8■□□□□ 0.923e-19■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.893e-19■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 CD81-204ENST00000468153 940 ntTSL 220.08■□□□□ 0.813e-19■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.493e-19■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-19■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 51.1
PCBP1Q15365 SREBF1-208ENST00000469356 1323 ntTSL 325.37■■□□□ 1.656e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.536e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SREBF1-210ENST00000471445 936 ntTSL 223.3■■□□□ 1.326e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 B3GAT3-203ENST00000532585 1534 ntTSL 1 (best)21.04■□□□□ 0.966e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.946e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 220.01■□□□□ 0.796e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SREBF1-219ENST00000580540 540 ntTSL 418.41■□□□□ 0.546e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-208ENST00000477235 1004 ntTSL 218.3■□□□□ 0.526e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SREBF1-221ENST00000583080 482 ntTSL 517.96■□□□□ 0.476e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.82■□□□□ 0.446e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.366e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-207ENST00000469045 890 ntTSL 516.29■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-214ENST00000497186 683 ntTSL 316.29■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 516.23■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-211ENST00000489538 475 ntTSL 315.27■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -06e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-209ENST00000480499 549 ntTSL 214.81□□□□□ -0.046e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SCAMP2-211ENST00000569251 867 ntTSL 214.34□□□□□ -0.116e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SREBF1-215ENST00000487401 477 ntTSL 213.86□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 HCLS1-205ENST00000473883 2710 ntTSL 212.84□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SCAMP2-207ENST00000566480 2476 ntTSL 512.68□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 SCAMP2-204ENST00000563829 3162 ntTSL 211.84□□□□□ -0.516e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.566e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.946e-9■■■■■ 51
PCBP1Q15365 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 51
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