RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP4-207ENST00000454947 ABCC9O60706 1549 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-207ENST00000454947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-207ENST00000454947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-207ENST00000454947 NACADO15069 1562 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-207ENST00000454947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-207ENST00000454947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-207ENST00000454947 SCRIBQ14160 1630 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-207ENST00000454947 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-207ENST00000454947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP4-207ENST00000454947 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.37■□□□□ 0.37
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SH3BP4-207ENST00000454947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SMARCA4P51532 1647 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-207ENST00000454947 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-207ENST00000454947 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4-207ENST00000454947 SMARCA2P51531 1590 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-207ENST00000454947 NCAPD3P42695 1498 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-207ENST00000454947 WIZO95785 1651 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGXB3Q12766 1538 aa17.04■□□□□ 0.32
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SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.7■□□□□ 0.26
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SH3BP4-207ENST00000454947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-207ENST00000454947 NESP48681 1621 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-207ENST00000454947 PRDM2Q13029 1718 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-207ENST00000454947 ERCC6Q03468 1493 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-207ENST00000454947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-207ENST00000454947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-207ENST00000454947 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCC8Q09428 1581 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR62O43379 1518 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 CUX1P39880 1505 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
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SH3BP4-207ENST00000454947 SYNJ1O43426 1573 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-207ENST00000454947 TOP2BQ02880 1626 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-207ENST00000454947 TOPBP1Q92547 1522 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-207ENST00000454947 CUX2O14529 1486 aa16.09■□□□□ 0.17
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SH3BP4-207ENST00000454947 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-207ENST00000454947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP4-207ENST00000454947 WDR97A6NE52 1622 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-207ENST00000454947 IFT140Q96RY7 1462 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM41Q8WV44 630 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 SOGA1O94964 1423 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF27Q86VH2 1401 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-207ENST00000454947 EEA1Q15075 1411 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-207ENST00000454947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-207ENST00000454947 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-207ENST00000454947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-207ENST00000454947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP4-207ENST00000454947 GRIN2BQ13224 1484 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-207ENST00000454947 IGF1RP08069 1367 aa15.69■□□□□ 0.1
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SH3BP4-207ENST00000454947 KIF21BO75037 1637 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNJ2O15056 1496 aa15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP4-207ENST00000454947 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP4-207ENST00000454947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CHD1O14646 1710 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGA3Q08378 1498 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FBLN2P98095 1184 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 NUP160Q12769 1436 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP170Q5SW79 1584 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 OSCARQ8IYS5 282 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.39■□□□□ 0.05
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