RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.7■■■■□ 3.14
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC9O60706 1549 aa31.27■■■□□ 2.6
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP4-205ENST00000444916 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP4-205ENST00000444916 NACADO15069 1562 aa29.17■■■□□ 2.26
SH3BP4-205ENST00000444916 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
SH3BP4-205ENST00000444916 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP4-205ENST00000444916 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP4-205ENST00000444916 SCRIBQ14160 1630 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP4-205ENST00000444916 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP4-205ENST00000444916 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-205ENST00000444916 CUX2O14529 1486 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP4-205ENST00000444916 SMARCA4P51532 1647 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NCAPD3P42695 1498 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ERCC6Q03468 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-205ENST00000444916 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP4-205ENST00000444916 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP4-205ENST00000444916 SMARCA2P51531 1590 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-205ENST00000444916 NESP48681 1621 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP4-205ENST00000444916 HMGXB3Q12766 1538 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-205ENST00000444916 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-205ENST00000444916 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-205ENST00000444916 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-205ENST00000444916 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-205ENST00000444916 WIZO95785 1651 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP4-205ENST00000444916 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-205ENST00000444916 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM41Q8WV44 630 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP4-205ENST00000444916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-205ENST00000444916 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-205ENST00000444916 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR62O43379 1518 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-205ENST00000444916 CFTRP13569 1480 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-205ENST00000444916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-205ENST00000444916 OSCARQ8IYS5 282 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM2Q13029 1718 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-205ENST00000444916 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT140Q96RY7 1462 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF11O15085 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4-205ENST00000444916 TOPBP1Q92547 1522 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC8Q09428 1581 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-205ENST00000444916 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-205ENST00000444916 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.623e-7■■■□□ 16
SH3BP4-205ENST00000444916 CHD1O14646 1710 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP4-205ENST00000444916 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SH3BP4-205ENST00000444916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-205ENST00000444916 ARAP1Q96P48 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-205ENST00000444916 FBLN2P98095 1184 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP4-205ENST00000444916 CUX1P39880 1505 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-205ENST00000444916 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-205ENST00000444916 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-205ENST00000444916 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-205ENST00000444916 SOGA1O94964 1423 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-205ENST00000444916 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR97A6NE52 1622 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP4-205ENST00000444916 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP4-205ENST00000444916 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-205ENST00000444916 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-205ENST00000444916 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-205ENST00000444916 TOP2BQ02880 1626 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNJ1O43426 1573 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-205ENST00000444916 GRIN2BQ13224 1484 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-205ENST00000444916 PBRM1Q86U86 1689 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-205ENST00000444916 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNJ2O15056 1496 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-205ENST00000444916 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTS12P58397 1594 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-205ENST00000444916 GRIN2AQ12879 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-205ENST00000444916 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP170Q5SW79 1584 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP160Q12769 1436 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF27Q86VH2 1401 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-205ENST00000444916 SHROOM2Q13796 1616 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-205ENST00000444916 CUL7Q14999 1698 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP4-205ENST00000444916 IGF1RP08069 1367 aa24.26■■□□□ 1.47
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