RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.68■■□□□ 1.7
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SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NACADO15069 1562 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4-206ENST00000446904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP4-206ENST00000446904 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SCRIBQ14160 1630 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4-206ENST00000446904 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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SH3BP4-206ENST00000446904 NCAPD3P42695 1498 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-206ENST00000446904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SMARCA4P51532 1647 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SMARCA2P51531 1590 aa19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP4-206ENST00000446904 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 HMGXB3Q12766 1538 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ERCC6Q03468 1493 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP4-206ENST00000446904 NESP48681 1621 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CUX2O14529 1486 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP4-206ENST00000446904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.58■□□□□ 0.73
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SH3BP4-206ENST00000446904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP4-206ENST00000446904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP4-206ENST00000446904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4-206ENST00000446904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4-206ENST00000446904 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-206ENST00000446904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-206ENST00000446904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR62O43379 1518 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-206ENST00000446904 CFTRP13569 1480 aa19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.27■□□□□ 0.67
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-206ENST00000446904 PRDM2Q13029 1718 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP4-206ENST00000446904 OSCARQ8IYS5 282 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP4-206ENST00000446904 TOPBP1Q92547 1522 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-206ENST00000446904 IFT140Q96RY7 1462 aa18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP4-206ENST00000446904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-206ENST00000446904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-206ENST00000446904 SOGA1O94964 1423 aa18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP4-206ENST00000446904 FBLN2P98095 1184 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP4-206ENST00000446904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CUX1P39880 1505 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF11O15085 1522 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CHD1O14646 1710 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4-206ENST00000446904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.52■□□□□ 0.55
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SH3BP4-206ENST00000446904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-206ENST00000446904 ARAP1Q96P48 1450 aa18.42■□□□□ 0.54
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SH3BP4-206ENST00000446904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.39■□□□□ 0.54
SH3BP4-206ENST00000446904 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNJ1O43426 1573 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP4-206ENST00000446904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-206ENST00000446904 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-206ENST00000446904 TOP2BQ02880 1626 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-206ENST00000446904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIN2AQ12879 1464 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAMTS12P58397 1594 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-206ENST00000446904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP160Q12769 1436 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP4-206ENST00000446904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-206ENST00000446904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-206ENST00000446904 SHROOM2Q13796 1616 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-206ENST00000446904 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-206ENST00000446904 JPH4Q96JJ6 628 aa18.02■□□□□ 0.48
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