Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 514.56□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-6■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.076e-7■■□□□ 12.7
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PUM1Q14671 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.076e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 514.52□□□□□ -0.086e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 532.64■■■□□ 2.826e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 531.76■■■□□ 2.676e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.956e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.866e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.696e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-206ENST00000491293 854 ntTSL 225.3■■□□□ 1.646e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.256e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-202ENST00000465199 588 ntTSL 522.21■■□□□ 1.156e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-207ENST00000492757 548 ntTSL 322.11■■□□□ 1.136e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-205ENST00000485896 1429 ntTSL 221.04■□□□□ 0.966e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 219.99■□□□□ 0.796e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.686e-18■■□□□ 12.7
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PUM1Q14671 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.546e-18■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 213.27□□□□□ -0.286e-7■■□□□ 12.7
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PUM1Q14671 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.442e-8■■□□□ 12.7
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PUM1Q14671 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-21■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-9■■□□□ 12.7
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PUM1Q14671 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-36■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-206ENST00000525717 1257 ntTSL 322.03■■□□□ 1.122e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-204ENST00000524762 763 ntTSL 319.53■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-208ENST00000527421 1085 ntTSL 519.21■□□□□ 0.672e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-215ENST00000533476 1912 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-207ENST00000526919 759 ntTSL 318.17■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-213ENST00000532904 2073 ntTSL 217.07■□□□□ 0.322e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-217ENST00000534176 943 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 UBXN1-205ENST00000525004 482 ntTSL 313.5□□□□□ -0.252e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 C9orf78-206ENST00000492991 478 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-28■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 C9orf78-203ENST00000461539 637 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-28■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.564e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-17■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 320.15■□□□□ 0.824e-66■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 418.17■□□□□ 0.54e-66■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 321.58■■□□□ 1.052e-10■■□□□ 12.6
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