RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485896.5

C1orf35-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 1,429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-205ENST00000485896 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.56■■■■■ 5.68
C1orf35-205ENST00000485896 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.94■■■■■ 4.79
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC9O60706 1549 aa44.08■■■■■ 4.65
C1orf35-205ENST00000485896 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.34■■■■■ 4.37
C1orf35-205ENST00000485896 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.33■■■■■ 4.37
C1orf35-205ENST00000485896 NACADO15069 1562 aa42.25■■■■■ 4.35
C1orf35-205ENST00000485896 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
C1orf35-205ENST00000485896 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
C1orf35-205ENST00000485896 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.77■■■■■ 4.28
C1orf35-205ENST00000485896 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.41■■■■■ 4.22
C1orf35-205ENST00000485896 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
C1orf35-205ENST00000485896 SCRIBQ14160 1630 aa41.1■■■■■ 4.17
C1orf35-205ENST00000485896 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.06■■■■■ 4.16
C1orf35-205ENST00000485896 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.54■■■■■ 4.08
C1orf35-205ENST00000485896 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.44■■■■■ 4.06
C1orf35-205ENST00000485896 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
C1orf35-205ENST00000485896 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.84■■■■□ 3.97
C1orf35-205ENST00000485896 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
C1orf35-205ENST00000485896 SMARCA4P51532 1647 aa39.26■■■■□ 3.88
C1orf35-205ENST00000485896 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
C1orf35-205ENST00000485896 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.03■■■■□ 3.84
C1orf35-205ENST00000485896 MROH2BQ7Z745 1585 aa39■■■■□ 3.83
C1orf35-205ENST00000485896 SMARCA2P51531 1590 aa38.98■■■■□ 3.83
C1orf35-205ENST00000485896 NCAPD3P42695 1498 aa38.97■■■■□ 3.83
C1orf35-205ENST00000485896 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.82■■■■□ 3.81
C1orf35-205ENST00000485896 HMGXB3Q12766 1538 aa38.8■■■■□ 3.8
C1orf35-205ENST00000485896 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
C1orf35-205ENST00000485896 WIZO95785 1651 aa38.6■■■■□ 3.77
C1orf35-205ENST00000485896 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
C1orf35-205ENST00000485896 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
C1orf35-205ENST00000485896 NESP48681 1621 aa38.14■■■■□ 3.7
C1orf35-205ENST00000485896 ERCC6Q03468 1493 aa37.99■■■■□ 3.67
C1orf35-205ENST00000485896 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.97■■■■□ 3.67
C1orf35-205ENST00000485896 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.86■■■■□ 3.65
C1orf35-205ENST00000485896 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.72■■■■□ 3.63
C1orf35-205ENST00000485896 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.71■■■■□ 3.63
C1orf35-205ENST00000485896 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.68■■■■□ 3.62
C1orf35-205ENST00000485896 CFTRP13569 1480 aa37.63■■■■□ 3.62
C1orf35-205ENST00000485896 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
C1orf35-205ENST00000485896 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
C1orf35-205ENST00000485896 CUX2O14529 1486 aa37.52■■■■□ 3.6
C1orf35-205ENST00000485896 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.46■■■■□ 3.59
C1orf35-205ENST00000485896 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.42■■■■□ 3.58
C1orf35-205ENST00000485896 PRDM2Q13029 1718 aa37.38■■■■□ 3.57
C1orf35-205ENST00000485896 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.36■■■■□ 3.57
C1orf35-205ENST00000485896 WDR62O43379 1518 aa37.22■■■■□ 3.55
C1orf35-205ENST00000485896 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
C1orf35-205ENST00000485896 TOPBP1Q92547 1522 aa36.86■■■■□ 3.49
C1orf35-205ENST00000485896 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.81■■■■□ 3.48
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC8Q09428 1581 aa36.79■■■■□ 3.48
C1orf35-205ENST00000485896 IFT140Q96RY7 1462 aa36.61■■■■□ 3.45
C1orf35-205ENST00000485896 CUX1P39880 1505 aa36.6■■■■□ 3.45
C1orf35-205ENST00000485896 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
C1orf35-205ENST00000485896 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.47■■■■□ 3.43
C1orf35-205ENST00000485896 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
C1orf35-205ENST00000485896 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.42■■■■□ 3.42
C1orf35-205ENST00000485896 SOGA1O94964 1423 aa36.39■■■■□ 3.42
C1orf35-205ENST00000485896 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.38■■■■□ 3.41
C1orf35-205ENST00000485896 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
C1orf35-205ENST00000485896 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
C1orf35-205ENST00000485896 SYNJ1O43426 1573 aa36.29■■■■□ 3.4
C1orf35-205ENST00000485896 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.43e-7■■■■■ 38.6
C1orf35-205ENST00000485896 TOP2BQ02880 1626 aa36.25■■■■□ 3.39
C1orf35-205ENST00000485896 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.25■■■■□ 3.39
C1orf35-205ENST00000485896 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
C1orf35-205ENST00000485896 WDR97A6NE52 1622 aa36.16■■■■□ 3.38
C1orf35-205ENST00000485896 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf35-205ENST00000485896 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf35-205ENST00000485896 OSCARQ8IYS5 282 aa35.97■■■■□ 3.35
C1orf35-205ENST00000485896 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.96■■■■□ 3.35
C1orf35-205ENST00000485896 GRIN2BQ13224 1484 aa35.96■■■■□ 3.35
C1orf35-205ENST00000485896 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.95■■■■□ 3.35
C1orf35-205ENST00000485896 PBRM1Q86U86 1689 aa35.93■■■■□ 3.34
C1orf35-205ENST00000485896 CHD1O14646 1710 aa35.91■■■■□ 3.34
C1orf35-205ENST00000485896 FBLN2P98095 1184 aa35.88■■■■□ 3.33
C1orf35-205ENST00000485896 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
C1orf35-205ENST00000485896 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
C1orf35-205ENST00000485896 SYNJ2O15056 1496 aa35.72■■■■□ 3.31
C1orf35-205ENST00000485896 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.65■■■■□ 3.3
C1orf35-205ENST00000485896 ADAMTS12P58397 1594 aa35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-205ENST00000485896 KIF27Q86VH2 1401 aa35.57■■■■□ 3.28
C1orf35-205ENST00000485896 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.54■■■■□ 3.28
C1orf35-205ENST00000485896 GRIN2AQ12879 1464 aa35.52■■■■□ 3.28
C1orf35-205ENST00000485896 TRIM41Q8WV44 630 aa35.49■■■■□ 3.27
C1orf35-205ENST00000485896 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.47■■■■□ 3.27
C1orf35-205ENST00000485896 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.45■■■■□ 3.26
C1orf35-205ENST00000485896 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.45■■■■□ 3.26
C1orf35-205ENST00000485896 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.45■■■■□ 3.26
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGEF11O15085 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
C1orf35-205ENST00000485896 IGF1RP08069 1367 aa35.42■■■■□ 3.26
C1orf35-205ENST00000485896 CEP170Q5SW79 1584 aa35.35■■■■□ 3.25
C1orf35-205ENST00000485896 CUL7Q14999 1698 aa35.34■■■■□ 3.25
C1orf35-205ENST00000485896 NUP160Q12769 1436 aa35.33■■■■□ 3.25
C1orf35-205ENST00000485896 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.29■■■■□ 3.24
C1orf35-205ENST00000485896 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-205ENST00000485896 ARAP1Q96P48 1450 aa35.15■■■■□ 3.22
C1orf35-205ENST00000485896 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.11■■■■□ 3.21
C1orf35-205ENST00000485896 SHROOM2Q13796 1616 aa35.07■■■■□ 3.2
C1orf35-205ENST00000485896 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.04■■■■□ 3.2
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