RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.92■■■■■ 9.58
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CTDNEP1-206ENST00000571409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa61.4■■■■■ 7.42
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.85■■■■■ 7.17
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SMARCA2P51531 1590 aa58.05■■■■■ 6.88
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.73■■■■■ 6.83
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CTDNEP1-206ENST00000571409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.42■■■■■ 6.62
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.86■■■■■ 6.53
CTDNEP1-206ENST00000571409 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.84■■■■■ 6.53
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CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR62O43379 1518 aa55.77■■■■■ 6.52
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TOPBP1Q92547 1522 aa54.89■■■■■ 6.38
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCC8Q09428 1581 aa54.81■■■■■ 6.37
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CTDNEP1-206ENST00000571409 IFT140Q96RY7 1462 aa54.71■■■■■ 6.35
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CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR97A6NE52 1622 aa53.86■■■■■ 6.21
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHD1O14646 1710 aa53.79■■■■■ 6.2
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CTDNEP1-206ENST00000571409 GRIN2BQ13224 1484 aa53.58■■■■■ 6.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.57■■■■■ 6.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.57■■■■■ 6.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 TOP2BQ02880 1626 aa53.56■■■■■ 6.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.53■■■■■ 6.16
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CTDNEP1-206ENST00000571409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.53■■■■■ 6.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 SYNJ1O43426 1573 aa53.53■■■■■ 6.16
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PBRM1Q86U86 1689 aa53.48■■■■■ 6.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.45■■■■■ 6.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGEF11O15085 1522 aa53.42■■■■■ 6.14
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAMTS12P58397 1594 aa52.99■■■■■ 6.07
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa52.39■■■■■ 5.98
CTDNEP1-206ENST00000571409 SHROOM2Q13796 1616 aa52.39■■■■■ 5.98
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGF1RP08069 1367 aa52.38■■■■■ 5.98
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TRHP20396 242 aaPredicted RBP52.15■■■■■ 5.94
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