RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599137.5

AKAP8L-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 8 like, human

TSL 4

Gene AKAP8L, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP8L-215	ENST00000599137	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.3	■■■■■ 4.84
AKAP8L-215	ENST00000599137	ABCC9	O60706	1549 aa		40.72	■■■■■ 4.11
AKAP8L-215	ENST00000599137	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.59	■■■■■ 4.09
AKAP8L-215	ENST00000599137	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.65	■■■■□ 3.78
AKAP8L-215	ENST00000599137	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.46	■■■■□ 3.75
AKAP8L-215	ENST00000599137	NACAD	O15069	1562 aa		38.35	■■■■□ 3.73
AKAP8L-215	ENST00000599137	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.08	■■■■□ 3.69
AKAP8L-215	ENST00000599137	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.95	■■■■□ 3.67
AKAP8L-215	ENST00000599137	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.86	■■■■□ 3.65
AKAP8L-215	ENST00000599137	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.71	■■■■□ 3.63
AKAP8L-215	ENST00000599137	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.54	■■■■□ 3.6
AKAP8L-215	ENST00000599137	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.52	■■■■□ 3.6
AKAP8L-215	ENST00000599137	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.29	■■■■□ 3.56
AKAP8L-215	ENST00000599137	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.18	■■■■□ 3.54
AKAP8L-215	ENST00000599137	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.87	■■■■□ 3.49
AKAP8L-215	ENST00000599137	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.72	■■■■□ 3.47
AKAP8L-215	ENST00000599137	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.61	■■■■□ 3.45
AKAP8L-215	ENST00000599137	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.6	■■■■□ 3.45
AKAP8L-215	ENST00000599137	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.37	■■■■□ 3.25
AKAP8L-215	ENST00000599137	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.36	■■■■□ 3.25
AKAP8L-215	ENST00000599137	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.35	■■■■□ 3.25
AKAP8L-215	ENST00000599137	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.25	■■■■□ 3.23
AKAP8L-215	ENST00000599137	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.16	■■■■□ 3.22
AKAP8L-215	ENST00000599137	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.16	■■■■□ 3.22
AKAP8L-215	ENST00000599137	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.15	■■■■□ 3.22
AKAP8L-215	ENST00000599137	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.07	■■■■□ 3.2
AKAP8L-215	ENST00000599137	NES	P48681	1621 aa		34.98	■■■■□ 3.19
AKAP8L-215	ENST00000599137	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.96	■■■■□ 3.19
AKAP8L-215	ENST00000599137	CUX2	O14529	1486 aa		34.9	■■■■□ 3.18
AKAP8L-215	ENST00000599137	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.89	■■■■□ 3.18
AKAP8L-215	ENST00000599137	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.84	■■■■□ 3.17
AKAP8L-215	ENST00000599137	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.62	■■■■□ 3.13
AKAP8L-215	ENST00000599137	WIZ	O95785	1651 aa		34.6	■■■■□ 3.13
AKAP8L-215	ENST00000599137	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.53	■■■■□ 3.12
AKAP8L-215	ENST00000599137	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.53	■■■■□ 3.12
AKAP8L-215	ENST00000599137	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.44	■■■■□ 3.1
AKAP8L-215	ENST00000599137	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.36	■■■■□ 3.09
AKAP8L-215	ENST00000599137	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.22	■■■■□ 3.07
AKAP8L-215	ENST00000599137	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		34.16	■■■■□ 3.06
AKAP8L-215	ENST00000599137	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.09	■■■■□ 3.05
AKAP8L-215	ENST00000599137	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34.07	■■■■□ 3.04
AKAP8L-215	ENST00000599137	WDR62	O43379	1518 aa		34.04	■■■■□ 3.04
AKAP8L-215	ENST00000599137	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.04	■■■■□ 3.04
AKAP8L-215	ENST00000599137	CFTR	P13569	1480 aa		33.95	■■■■□ 3.03
AKAP8L-215	ENST00000599137	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
AKAP8L-215	ENST00000599137	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.72	■■■□□ 2.99
AKAP8L-215	ENST00000599137	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.7	■■■□□ 2.98
AKAP8L-215	ENST00000599137	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.57	■■■□□ 2.96
AKAP8L-215	ENST00000599137	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.38	■■■□□ 2.93
AKAP8L-215	ENST00000599137	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.38	■■■□□ 2.93
AKAP8L-215	ENST00000599137	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
AKAP8L-215	ENST00000599137	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.33	■■■□□ 2.93
AKAP8L-215	ENST00000599137	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.26	■■■□□ 2.91
AKAP8L-215	ENST00000599137	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.21	■■■□□ 2.91
AKAP8L-215	ENST00000599137	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
AKAP8L-215	ENST00000599137	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88	8e-8	■■■■■ 39.3
AKAP8L-215	ENST00000599137	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
AKAP8L-215	ENST00000599137	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
AKAP8L-215	ENST00000599137	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.99	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	CHD1	O14646	1710 aa		32.96	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	FBLN2	P98095	1184 aa		32.95	■■■□□ 2.87
AKAP8L-215	ENST00000599137	SOGA1	O94964	1423 aa		32.91	■■■□□ 2.86
AKAP8L-215	ENST00000599137	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
AKAP8L-215	ENST00000599137	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.88	■■■□□ 2.85
AKAP8L-215	ENST00000599137	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.87	■■■□□ 2.85
AKAP8L-215	ENST00000599137	CUX1	P39880	1505 aa		32.86	■■■□□ 2.85
AKAP8L-215	ENST00000599137	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.74	■■■□□ 2.83
AKAP8L-215	ENST00000599137	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.7	■■■□□ 2.83
AKAP8L-215	ENST00000599137	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.62	■■■□□ 2.81
AKAP8L-215	ENST00000599137	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
AKAP8L-215	ENST00000599137	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.59	■■■□□ 2.81
AKAP8L-215	ENST00000599137	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.56	■■■□□ 2.8
AKAP8L-215	ENST00000599137	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
AKAP8L-215	ENST00000599137	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AKAP8L-215	ENST00000599137	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AKAP8L-215	ENST00000599137	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AKAP8L-215	ENST00000599137	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AKAP8L-215	ENST00000599137	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.46	■■■□□ 2.79
AKAP8L-215	ENST00000599137	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AKAP8L-215	ENST00000599137	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AKAP8L-215	ENST00000599137	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
AKAP8L-215	ENST00000599137	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77
AKAP8L-215	ENST00000599137	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.3	■■■□□ 2.76
AKAP8L-215	ENST00000599137	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.29	■■■□□ 2.76
AKAP8L-215	ENST00000599137	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.19	■■■□□ 2.74
AKAP8L-215	ENST00000599137	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.18	■■■□□ 2.74
AKAP8L-215	ENST00000599137	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.1	■■■□□ 2.73
AKAP8L-215	ENST00000599137	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.07	■■■□□ 2.72
AKAP8L-215	ENST00000599137	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.06	■■■□□ 2.72
AKAP8L-215	ENST00000599137	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.02	■■■□□ 2.72
AKAP8L-215	ENST00000599137	NUP160	Q12769	1436 aa		32.01	■■■□□ 2.72
AKAP8L-215	ENST00000599137	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.88	■■■□□ 2.69
AKAP8L-215	ENST00000599137	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
AKAP8L-215	ENST00000599137	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.75	■■■□□ 2.67
AKAP8L-215	ENST00000599137	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.74	■■■□□ 2.67
AKAP8L-215	ENST00000599137	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.68	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms