RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492757.5

C1orf35-207, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf35, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-207ENST00000492757 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.02■■■■■ 5.92
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C1orf35-207ENST00000492757 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.68■■■■■ 4.58
C1orf35-207ENST00000492757 NACADO15069 1562 aa43.56■■■■■ 4.56
C1orf35-207ENST00000492757 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.44■■■■■ 4.54
C1orf35-207ENST00000492757 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
C1orf35-207ENST00000492757 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
C1orf35-207ENST00000492757 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43■■■■■ 4.47
C1orf35-207ENST00000492757 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.93■■■■■ 4.46
C1orf35-207ENST00000492757 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.81■■■■■ 4.44
C1orf35-207ENST00000492757 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.67■■■■■ 4.42
C1orf35-207ENST00000492757 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.44■■■■■ 4.39
C1orf35-207ENST00000492757 SCRIBQ14160 1630 aa42.32■■■■■ 4.37
C1orf35-207ENST00000492757 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.85■■■■■ 4.29
C1orf35-207ENST00000492757 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.45■■■■■ 4.23
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C1orf35-207ENST00000492757 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.33■■■■■ 4.21
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C1orf35-207ENST00000492757 NCAPD3P42695 1498 aa40.19■■■■■ 4.02
C1orf35-207ENST00000492757 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
C1orf35-207ENST00000492757 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.14■■■■■ 4.02
C1orf35-207ENST00000492757 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.02■■■■■ 4
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C1orf35-207ENST00000492757 ERCC6Q03468 1493 aa39.67■■■■□ 3.94
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C1orf35-207ENST00000492757 CUX2O14529 1486 aa39.56■■■■□ 3.92
C1orf35-207ENST00000492757 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.46■■■■□ 3.91
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C1orf35-207ENST00000492757 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.18■■■■□ 3.86
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C1orf35-207ENST00000492757 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.99■■■■□ 3.83
C1orf35-207ENST00000492757 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.94■■■■□ 3.82
C1orf35-207ENST00000492757 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.89■■■■□ 3.82
C1orf35-207ENST00000492757 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.77■■■■□ 3.8
C1orf35-207ENST00000492757 CFTRP13569 1480 aa38.76■■■■□ 3.8
C1orf35-207ENST00000492757 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.6■■■■□ 3.77
C1orf35-207ENST00000492757 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.59■■■■□ 3.77
C1orf35-207ENST00000492757 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.55■■■■□ 3.76
C1orf35-207ENST00000492757 PRDM2Q13029 1718 aa38.54■■■■□ 3.76
C1orf35-207ENST00000492757 WDR62O43379 1518 aa38.48■■■■□ 3.75
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C1orf35-207ENST00000492757 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
C1orf35-207ENST00000492757 TOPBP1Q92547 1522 aa37.97■■■■□ 3.67
C1orf35-207ENST00000492757 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.92■■■■□ 3.66
C1orf35-207ENST00000492757 ABCC8Q09428 1581 aa37.86■■■■□ 3.65
C1orf35-207ENST00000492757 TRIM41Q8WV44 630 aa37.83■■■■□ 3.65
C1orf35-207ENST00000492757 IFT140Q96RY7 1462 aa37.72■■■■□ 3.63
C1orf35-207ENST00000492757 OSCARQ8IYS5 282 aa37.7■■■■□ 3.63
C1orf35-207ENST00000492757 CUX1P39880 1505 aa37.66■■■■□ 3.62
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C1orf35-207ENST00000492757 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
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C1orf35-207ENST00000492757 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.53■■■■□ 3.6
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C1orf35-207ENST00000492757 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.5■■■■□ 3.59
C1orf35-207ENST00000492757 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
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C1orf35-207ENST00000492757 SYNJ1O43426 1573 aa37.3■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 WDR97A6NE52 1622 aa37.3■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.28■■■■□ 3.56
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C1orf35-207ENST00000492757 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 TOP2BQ02880 1626 aa37.27■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
C1orf35-207ENST00000492757 CHD1O14646 1710 aa37.16■■■■□ 3.54
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C1orf35-207ENST00000492757 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.07■■■■□ 3.52
C1orf35-207ENST00000492757 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.05■■■■□ 3.52
C1orf35-207ENST00000492757 PBRM1Q86U86 1689 aa37.04■■■■□ 3.52
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C1orf35-207ENST00000492757 GRIN2BQ13224 1484 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf35-207ENST00000492757 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.01■■■■□ 3.52
C1orf35-207ENST00000492757 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
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C1orf35-207ENST00000492757 SYNJ2O15056 1496 aa36.82■■■■□ 3.48
C1orf35-207ENST00000492757 ARAP1Q96P48 1450 aa36.76■■■■□ 3.48
C1orf35-207ENST00000492757 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
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C1orf35-207ENST00000492757 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
C1orf35-207ENST00000492757 KIF27Q86VH2 1401 aa36.49■■■■□ 3.43
C1orf35-207ENST00000492757 CEP170Q5SW79 1584 aa36.46■■■■□ 3.43
C1orf35-207ENST00000492757 NUP160Q12769 1436 aa36.42■■■■□ 3.42
C1orf35-207ENST00000492757 IGF1RP08069 1367 aa36.39■■■■□ 3.42
C1orf35-207ENST00000492757 CUL7Q14999 1698 aa36.34■■■■□ 3.41
C1orf35-207ENST00000492757 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.23■■■■□ 3.39
C1orf35-207ENST00000492757 SHROOM2Q13796 1616 aa36.21■■■■□ 3.39
C1orf35-207ENST00000492757 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.19■■■■□ 3.38
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