Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 58.83□□□□□ -11e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.641e-8■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.876e-13■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-207ENST00000578624 583 ntTSL 411.64□□□□□ -0.552e-12■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FN1-226ENST00000496542 695 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-17■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 WDR59-208ENST00000563111 583 ntTSL 410.71□□□□□ -0.692e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-208ENST00000578853 905 ntTSL 313.85□□□□□ -0.191e-12■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CNNM3-205ENST00000494595 400 ntTSL 513.89□□□□□ -0.197e-7■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 PSMA3-AS1-211ENST00000556225 839 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.077e-12■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.314e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 222.34■■□□□ 1.174e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 321.05■□□□□ 0.964e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.94e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CHDH-203ENST00000481668 631 ntTSL 219.37■□□□□ 0.695e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MYO19-223ENST00000620869 574 ntTSL 418.95■□□□□ 0.624e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-210ENST00000534515 1793 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-203ENST00000528087 1701 ntTSL 217.74■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.394e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MMD-202ENST00000571578 670 ntTSL 316.36■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TEN1-CDK3-201ENST00000567351 3897 ntTSL 216.22■□□□□ 0.194e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-212ENST00000542982 809 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.094e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-204ENST00000529000 543 ntTSL 515.23■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 GSDMD-214ENST00000533888 576 ntTSL 414.59□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 GSDMD-213ENST00000533348 724 ntTSL 514.06□□□□□ -0.164e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-202ENST00000524743 558 ntTSL 413.83□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MCM4-206ENST00000519138 927 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 POLD4-209ENST00000533429 860 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-216ENST00000580918 769 ntTSL 311.25□□□□□ -0.616e-13■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CDK3-204ENST00000588812 570 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FARP2-208ENST00000445489 538 ntTSL 210.84□□□□□ -0.674e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MCM4-207ENST00000519170 734 ntTSL 310.82□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FAAH-205ENST00000493636 527 ntTSL 310.76□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CTSB-207ENST00000524654 368 ntTSL 510.39□□□□□ -0.754e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-212ENST00000497135 1207 ntTSL 510.3□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FARP2-209ENST00000464142 442 ntTSL 310.28□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-226ENST00000582843 570 ntTSL 410.15□□□□□ -0.786e-13■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-211ENST00000491650 842 ntTSL 510.02□□□□□ -0.814e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DDX17-207ENST00000475004 443 ntTSL 39.96□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FARP2-205ENST00000418082 456 ntTSL 49.82□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-210ENST00000479305 791 ntTSL 29.81□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.934e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MYO19-201ENST00000610496 578 ntTSL 38.92□□□□□ -0.984e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DDX17-210ENST00000497196 856 ntTSL 38.08□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.51□□□□□ -1.214e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-210ENST00000554704 2698 ntTSL 27.35□□□□□ -1.234e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FARP2-210ENST00000467260 471 ntTSL 36.94□□□□□ -1.34e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.564e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-209ENST00000554652 4487 ntTSL 25□□□□□ -1.614e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 DENND1A-205ENST00000462245 739 ntTSL 24.92□□□□□ -1.624e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 FARP2-213ENST00000473082 397 ntTSL 34.52□□□□□ -1.694e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.744e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 ABCD3-205ENST00000484213 4367 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.764e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 RALGAPA1-211ENST00000555828 125 ntTSL 32.05□□□□□ -2.084e-6■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 53.02□□□□□ -1.935e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 MLH1-205ENST00000432299 928 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.767e-10■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.841e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.311e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.471e-9■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 PPP4R3A-204ENST00000554574 1944 ntTSL 24.69□□□□□ -1.667e-10■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.991e-7■□□□□ 8.8
EFTUD2Q15029 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 58.42□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 PRPF4B-204ENST00000466185 1297 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FN1-223ENST00000490833 699 ntTSL 36.42□□□□□ -1.381e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FN1-221ENST00000480737 384 ntTSL 22.58□□□□□ -21e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MAN2C1-218ENST00000563794 818 ntTSL 314.32□□□□□ -0.125e-14■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 218.55■□□□□ 0.565e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 317.01■□□□□ 0.315e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HDAC5-210ENST00000591714 667 ntTSL 315.66■□□□□ 0.15e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 NR1H2-208ENST00000597157 856 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.191e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.834e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.664e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 EMC8-204ENST00000596852 486 ntTSL 217.76■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MRPS25-204ENST00000447299 723 ntTSL 314.97□□□□□ -0.014e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MRPS25-202ENST00000420267 590 ntTSL 411.77□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.64e-7■□□□□ 8.7
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3897.3 ms