RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556225.1

PSMA3-AS1-211, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 839 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.06■■□□□ 1.6
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.59■■□□□ 1.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.18■□□□□ 0.82
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ADRA2BP18089 450 aa19.62■□□□□ 0.73
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.22■□□□□ 0.67
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.19■□□□□ 0.66
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 NACADO15069 1562 aa19.09■□□□□ 0.65
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.05■□□□□ 0.64
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.72■□□□□ 0.59
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.59■□□□□ 0.57
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SCRIBQ14160 1630 aa18.5■□□□□ 0.55
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.33■□□□□ 0.52
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.27■□□□□ 0.52
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.23■□□□□ 0.51
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 NCAPD3P42695 1498 aa17.65■□□□□ 0.42
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.63■□□□□ 0.41
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SMARCA4P51532 1647 aa17.61■□□□□ 0.41
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SMARCA2P51531 1590 aa17.54■□□□□ 0.4
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 HMGXB3Q12766 1538 aa17.5■□□□□ 0.39
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ERCC6Q03468 1493 aa17.47■□□□□ 0.39
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.45■□□□□ 0.38
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 NESP48681 1621 aa17.45■□□□□ 0.38
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.4■□□□□ 0.38
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.39■□□□□ 0.37
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CUX2O14529 1486 aa17.36■□□□□ 0.37
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.26■□□□□ 0.35
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 WIZO95785 1651 aa17.25■□□□□ 0.35
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.22■□□□□ 0.35
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.17■□□□□ 0.34
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.15■□□□□ 0.34
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.15■□□□□ 0.34
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PSMA3-AS1-211ENST00000556225 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.95■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 WDR62O43379 1518 aa16.95■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CFTRP13569 1480 aa16.94■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.94■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.84■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 PRDM2Q13029 1718 aa16.72■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 TRIM41Q8WV44 630 aa16.71■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 OSCARQ8IYS5 282 aa16.64■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 TOPBP1Q92547 1522 aa16.64■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 KCNA4P22459 653 aa16.61■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 IFT140Q96RY7 1462 aa16.6■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RNF39Q9H2S5 420 aa16.59■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.55■□□□□ 0.24
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ABCC8Q09428 1581 aa16.52■□□□□ 0.24
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.231e-8■■■□□ 16.1
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.47■□□□□ 0.23
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 FBLN2P98095 1184 aa16.42■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SOGA1O94964 1423 aa16.42■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.41■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.41■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.41■□□□□ 0.22
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.39■□□□□ 0.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CUX1P39880 1505 aa16.38■□□□□ 0.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CHD1O14646 1710 aa16.37■□□□□ 0.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 ARHGEF11O15085 1522 aa16.36■□□□□ 0.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.31■□□□□ 0.2
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.29■□□□□ 0.2
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PSMA3-AS1-211ENST00000556225 GRIN2BQ13224 1484 aa16.23■□□□□ 0.19
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