Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PABPC4-207ENST00000451091 898 ntTSL 327.54■■■□□ 21e-7■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 425.75■■□□□ 1.713e-14■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 320.21■□□□□ 0.833e-14■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 215.97■□□□□ 0.153e-14■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STARD10-217ENST00000543089 506 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.889e-7■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STARD10-219ENST00000544767 509 ntTSL 318.79■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 STARD10-208ENST00000536728 451 ntTSL 57.65□□□□□ -1.189e-7■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.753e-16■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.23e-16■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.843e-16■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-16■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 USP25-208ENST00000478932 2605 ntTSL 1 (best)4.61□□□□□ -1.673e-16■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 CDK16-206ENST00000462827 664 ntTSL 513.98□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-31■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 58.78□□□□□ -17e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.157e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.437e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 26.06□□□□□ -1.447e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 35.55□□□□□ -1.527e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 34.21□□□□□ -1.747e-10■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 MRPL52-209ENST00000553965 327 ntTSL 24.53□□□□□ -1.681e-9■■■■□ 26.7
PABPC4Q13310 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.946e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.391e-18■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 317.1■□□□□ 0.335e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 516.12■□□□□ 0.175e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.085e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 214.22□□□□□ -0.135e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-222ENST00000551172 699 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-230ENST00000552914 734 ntTSL 37.35□□□□□ -1.235e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-229ENST00000552499 555 ntTSL 36.09□□□□□ -1.435e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MARS-209ENST00000547665 670 ntTSL 24.87□□□□□ -1.635e-8■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NME1-205ENST00000465188 521 ntTSL 210.63□□□□□ -0.713e-39■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NME1-204ENST00000456492 510 ntTSL 26.07□□□□□ -1.443e-39■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.311e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RND2-201ENST00000587117 503 ntTSL 433.61■■■□□ 2.973e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 1424 ntTSL 229.2■■■□□ 2.273e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.213e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.053e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.873e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.763e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.673e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 224.94■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.543e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PTPN18-211ENST00000481492 1394 ntTSL 224.61■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.53e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.483e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.453e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CD99-207ENST00000482293 466 ntTSL 224.02■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-209ENST00000561689 1957 ntTSL 223.88■■□□□ 1.413e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.383e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.353e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-206ENST00000568224 1721 ntTSL 1 (best)23.34■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-260ENST00000637578 1577 ntTSL 223.17■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.263e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.263e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.233e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-201ENST00000436104 1990 ntTSL 222.72■■□□□ 1.232e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PTPN18-207ENST00000462321 1717 ntTSL 222.7■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-250ENST00000636839 2018 ntTSL 522.69■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-230ENST00000568076 1968 ntTSL 522.5■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PTPN18-203ENST00000409022 993 ntTSL 322.41■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TMEM52-202ENST00000378598 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.36■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CD99-206ENST00000449611 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.17■■□□□ 1.143e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.082e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-258ENST00000637184 1753 ntTSL 521.71■■□□□ 1.073e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SMIM19-206ENST00000498447 878 ntTSL 321.55■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-233ENST00000568452 1616 ntTSL 521.43■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-239ENST00000628023 1183 ntTSL 521.36■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-247ENST00000636351 1292 ntTSL 521.31■■□□□ 13e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.993e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-207ENST00000562513 1669 ntTSL 521.21■□□□□ 0.992e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-212ENST00000533527 1787 ntTSL 221.15■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.973e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-211ENST00000564091 790 ntTSL 520.67■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.883e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-210ENST00000563885 1931 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-209ENST00000528412 2215 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.873e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-217ENST00000565354 759 ntTSL 520.43■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.862e-11■■■■□ 26.6
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