RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.78■■■■■ 5.4
RPS20-210ENST00000523936 ABCC9O60706 1549 aa44.03■■■■■ 4.64
RPS20-210ENST00000523936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.95■■■■■ 4.63
RPS20-210ENST00000523936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.88■■■■■ 4.3
RPS20-210ENST00000523936 NACADO15069 1562 aa41.55■■■■■ 4.24
RPS20-210ENST00000523936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.5■■■■■ 4.23
RPS20-210ENST00000523936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.11■■■■■ 4.17
RPS20-210ENST00000523936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.04■■■■■ 4.16
RPS20-210ENST00000523936 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.94■■■■■ 4.14
RPS20-210ENST00000523936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
RPS20-210ENST00000523936 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.69■■■■■ 4.11
RPS20-210ENST00000523936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
RPS20-210ENST00000523936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.32■■■■■ 4.05
RPS20-210ENST00000523936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.13■■■■■ 4.02
RPS20-210ENST00000523936 SCRIBQ14160 1630 aa39.93■■■■□ 3.98
RPS20-210ENST00000523936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.83■■■■□ 3.97
RPS20-210ENST00000523936 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.7■■■■□ 3.95
RPS20-210ENST00000523936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
RPS20-210ENST00000523936 NCAPD3P42695 1498 aa38.35■■■■□ 3.73
RPS20-210ENST00000523936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.29■■■■□ 3.72
RPS20-210ENST00000523936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.18■■■■□ 3.7
RPS20-210ENST00000523936 SMARCA4P51532 1647 aa38.12■■■■□ 3.69
RPS20-210ENST00000523936 CUX2O14529 1486 aa38.09■■■■□ 3.69
RPS20-210ENST00000523936 SMARCA2P51531 1590 aa38.08■■■■□ 3.69
RPS20-210ENST00000523936 HMGXB3Q12766 1538 aa38.07■■■■□ 3.68
RPS20-210ENST00000523936 ERCC6Q03468 1493 aa38.02■■■■□ 3.68
RPS20-210ENST00000523936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
RPS20-210ENST00000523936 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.79■■■■□ 3.64
RPS20-210ENST00000523936 NESP48681 1621 aa37.78■■■■□ 3.64
RPS20-210ENST00000523936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
RPS20-210ENST00000523936 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.56■■■■□ 3.6
RPS20-210ENST00000523936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.55■■■■□ 3.6
RPS20-210ENST00000523936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
RPS20-210ENST00000523936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.37■■■■□ 3.57
RPS20-210ENST00000523936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.27■■■■□ 3.56
RPS20-210ENST00000523936 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.14■■■■□ 3.54
RPS20-210ENST00000523936 WIZO95785 1651 aa37.13■■■■□ 3.53
RPS20-210ENST00000523936 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.97■■■■□ 3.51
RPS20-210ENST00000523936 WDR62O43379 1518 aa36.93■■■■□ 3.5
RPS20-210ENST00000523936 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.78■■■■□ 3.48
RPS20-210ENST00000523936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.71■■■■□ 3.47
RPS20-210ENST00000523936 CFTRP13569 1480 aa36.69■■■■□ 3.46
RPS20-210ENST00000523936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
RPS20-210ENST00000523936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
RPS20-210ENST00000523936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
RPS20-210ENST00000523936 PRDM2Q13029 1718 aa36.44■■■■□ 3.42
RPS20-210ENST00000523936 TRIM41Q8WV44 630 aa36.43■■■■□ 3.42
RPS20-210ENST00000523936 OSCARQ8IYS5 282 aa36.26■■■■□ 3.4
RPS20-210ENST00000523936 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.2■■■■□ 3.39
RPS20-210ENST00000523936 IFT140Q96RY7 1462 aa36.06■■■■□ 3.36
RPS20-210ENST00000523936 TOPBP1Q92547 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
RPS20-210ENST00000523936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
RPS20-210ENST00000523936 ABCC8Q09428 1581 aa35.94■■■■□ 3.34
RPS20-210ENST00000523936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
RPS20-210ENST00000523936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
RPS20-210ENST00000523936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
RPS20-210ENST00000523936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.88■■■■□ 3.33
RPS20-210ENST00000523936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
RPS20-210ENST00000523936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF11O15085 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
RPS20-210ENST00000523936 CHD1O14646 1710 aa35.66■■■■□ 3.3
RPS20-210ENST00000523936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.37e-10■■■■□ 22.4
RPS20-210ENST00000523936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
RPS20-210ENST00000523936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.47■■■■□ 3.27
RPS20-210ENST00000523936 SOGA1O94964 1423 aa35.43■■■■□ 3.26
RPS20-210ENST00000523936 WDR97A6NE52 1622 aa35.4■■■■□ 3.26
RPS20-210ENST00000523936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.4■■■■□ 3.26
RPS20-210ENST00000523936 FBLN2P98095 1184 aa35.38■■■■□ 3.25
RPS20-210ENST00000523936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
RPS20-210ENST00000523936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.36■■■■□ 3.25
RPS20-210ENST00000523936 ARAP1Q96P48 1450 aa35.35■■■■□ 3.25
RPS20-210ENST00000523936 CUX1P39880 1505 aa35.31■■■■□ 3.24
RPS20-210ENST00000523936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.28■■■■□ 3.24
RPS20-210ENST00000523936 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.22■■■■□ 3.23
RPS20-210ENST00000523936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RPS20-210ENST00000523936 GRIN2BQ13224 1484 aa35.16■■■■□ 3.22
RPS20-210ENST00000523936 SYNJ1O43426 1573 aa35.16■■■■□ 3.22
RPS20-210ENST00000523936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
RPS20-210ENST00000523936 PBRM1Q86U86 1689 aa35.1■■■■□ 3.21
RPS20-210ENST00000523936 SYNJ2O15056 1496 aa35.09■■■■□ 3.21
RPS20-210ENST00000523936 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
RPS20-210ENST00000523936 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.01■■■■□ 3.19
RPS20-210ENST00000523936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.98■■■■□ 3.19
RPS20-210ENST00000523936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.97■■■■□ 3.19
RPS20-210ENST00000523936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
RPS20-210ENST00000523936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.75■■■■□ 3.15
RPS20-210ENST00000523936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.15
RPS20-210ENST00000523936 GRIN2AQ12879 1464 aa34.72■■■■□ 3.15
RPS20-210ENST00000523936 TOP2BQ02880 1626 aa34.71■■■■□ 3.15
RPS20-210ENST00000523936 ADAMTS12P58397 1594 aa34.7■■■■□ 3.15
RPS20-210ENST00000523936 NUP160Q12769 1436 aa34.64■■■■□ 3.14
RPS20-210ENST00000523936 CEP170Q5SW79 1584 aa34.63■■■■□ 3.13
RPS20-210ENST00000523936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.62■■■■□ 3.13
RPS20-210ENST00000523936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.56■■■■□ 3.12
RPS20-210ENST00000523936 SHROOM2Q13796 1616 aa34.56■■■■□ 3.12
RPS20-210ENST00000523936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
RPS20-210ENST00000523936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
RPS20-210ENST00000523936 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.25■■■■□ 3.07
RPS20-210ENST00000523936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.23■■■■□ 3.07
RPS20-210ENST00000523936 JPH4Q96JJ6 628 aa34.22■■■■□ 3.07
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