RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 POTEDQ86YR6 584 aa9.75□□□□□ -0.85
USP25-208ENST00000478932 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP25-208ENST00000478932 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.12□□□□□ -0.95
USP25-208ENST00000478932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.99□□□□□ -0.97
USP25-208ENST00000478932 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
USP25-208ENST00000478932 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
USP25-208ENST00000478932 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.66□□□□□ -1.18
USP25-208ENST00000478932 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.64□□□□□ -1.19
USP25-208ENST00000478932 FOXD1Q16676 465 aa7.63□□□□□ -1.19
USP25-208ENST00000478932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.58□□□□□ -1.2
USP25-208ENST00000478932 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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USP25-208ENST00000478932 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP25-208ENST00000478932 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.21□□□□□ -1.26
USP25-208ENST00000478932 SCRIBQ14160 1630 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP25-208ENST00000478932 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
USP25-208ENST00000478932 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.08□□□□□ -1.28
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USP25-208ENST00000478932 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.06□□□□□ -1.28
USP25-208ENST00000478932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP25-208ENST00000478932 ADRA2BP18089 450 aa7.04□□□□□ -1.28
USP25-208ENST00000478932 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP25-208ENST00000478932 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.99□□□□□ -1.29
USP25-208ENST00000478932 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.96□□□□□ -1.29
USP25-208ENST00000478932 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.92□□□□□ -1.3
USP25-208ENST00000478932 WIZO95785 1651 aa6.92□□□□□ -1.3
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USP25-208ENST00000478932 SMARCA4P51532 1647 aa6.86□□□□□ -1.31
USP25-208ENST00000478932 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.85□□□□□ -1.31
USP25-208ENST00000478932 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP25-208ENST00000478932 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.8□□□□□ -1.32
USP25-208ENST00000478932 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.79□□□□□ -1.32
USP25-208ENST00000478932 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
USP25-208ENST00000478932 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.79□□□□□ -1.32
USP25-208ENST00000478932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.77□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 SMARCA2P51531 1590 aa6.76□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.73□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 ABCC8Q09428 1581 aa6.71□□□□□ -1.33
USP25-208ENST00000478932 NCAPD3P42695 1498 aa6.68□□□□□ -1.34
USP25-208ENST00000478932 SOGA1O94964 1423 aa6.64□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.63□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 HMGXB3Q12766 1538 aa6.62□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.61□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.61□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.6□□□□□ -1.35
USP25-208ENST00000478932 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP25-208ENST00000478932 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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USP25-208ENST00000478932 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP25-208ENST00000478932 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.53□□□□□ -1.36
USP25-208ENST00000478932 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
USP25-208ENST00000478932 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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USP25-208ENST00000478932 NESP48681 1621 aa6.51□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 CUX1P39880 1505 aa6.51□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 TOP2BQ02880 1626 aa6.5□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 CEP162Q5TB80 1403 aa6.49□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.49□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.47□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.47□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 GOLGA3Q08378 1498 aa6.47□□□□□ -1.37
USP25-208ENST00000478932 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.46□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.46□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 KIF27Q86VH2 1401 aa6.44□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 HRCP23327 699 aa6.44□□□□□ -1.38
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USP25-208ENST00000478932 CUX2O14529 1486 aa6.43□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 IGF1RP08069 1367 aa6.42□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 PRXQ9BXM0 1461 aa6.42□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.42□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 CLIP1P30622 1438 aa6.41□□□□□ -1.38
USP25-208ENST00000478932 KIF21BO75037 1637 aa6.41□□□□□ -1.38
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USP25-208ENST00000478932 PRDM2Q13029 1718 aa6.4□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 TOPBP1Q92547 1522 aa6.4□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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USP25-208ENST00000478932 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.39□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 APLP2Q06481 763 aa6.37□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.37□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 P3H3Q8IVL6 736 aa6.35□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.35□□□□□ -1.39
USP25-208ENST00000478932 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.34□□□□□ -1.39
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