RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.84■■■■■ 5.89
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.05■■■■■ 4.48
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NACADO15069 1562 aa42.83■■■■■ 4.45
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.7■■■■■ 4.43
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SCRIBQ14160 1630 aa41.83■■■■■ 4.29
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.76■■■■■ 4.28
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.42■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.33■■■■■ 4.05
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMARCA4P51532 1647 aa40.06■■■■■ 4
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.66■■■■□ 3.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WIZO95785 1651 aa39.59■■■■□ 3.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NCAPD3P42695 1498 aa39.53■■■■□ 3.92
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.35■■■■□ 3.73
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.97■■■■□ 3.67
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.93■■■■□ 3.66
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERCC6Q03468 1493 aa37.92■■■■□ 3.66
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.65■■■■□ 3.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR62O43379 1518 aa37.51■■■■□ 3.59
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.591e-6■■■■■ 58.5
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CUX1P39880 1505 aa37.46■■■■□ 3.59
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.31■■■■□ 3.56
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IFT140Q96RY7 1462 aa37.03■■■■□ 3.52
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.57■■■■□ 3.45
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.44■■■■□ 3.42
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EEA1Q15075 1411 aa36.41■■■■□ 3.42
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.38■■■■□ 3.41
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.29■■■■□ 3.4
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FBLN2P98095 1184 aa36.13■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHD1O14646 1710 aa36.09■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.07■■■■□ 3.37
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRIN2AQ12879 1464 aa36.06■■■■□ 3.36
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF21BO75037 1637 aa35.99■■■■□ 3.35
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NUP160Q12769 1436 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OSCARQ8IYS5 282 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CEP170Q5SW79 1584 aa35.86■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GOLGA3Q08378 1498 aa35.84■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.83■■■■□ 3.33
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.72■■■■□ 3.31
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