RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563885.5

CENPT-210, Transcript of centromere protein T, humanhuman

TSL 5

Gene CENPT, Length 1,931 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPT-210ENST00000563885 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.56■■■■■ 4.08
CENPT-210ENST00000563885 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.16■■■■□ 3.22
CENPT-210ENST00000563885 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CENPT-210ENST00000563885 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.56■■■□□ 2.96
CENPT-210ENST00000563885 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.46■■■□□ 2.95
CENPT-210ENST00000563885 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.27■■■□□ 2.92
CENPT-210ENST00000563885 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.95■■■□□ 2.87
CENPT-210ENST00000563885 ABCC9O60706 1549 aa32.68■■■□□ 2.82
CENPT-210ENST00000563885 NACADO15069 1562 aa32.58■■■□□ 2.81
CENPT-210ENST00000563885 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
CENPT-210ENST00000563885 SCRIBQ14160 1630 aa32.39■■■□□ 2.78
CENPT-210ENST00000563885 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.18■■■□□ 2.74
CENPT-210ENST00000563885 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CENPT-210ENST00000563885 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.61■■■□□ 2.65
CENPT-210ENST00000563885 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.45■■■□□ 2.63
CENPT-210ENST00000563885 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.37■■■□□ 2.61
CENPT-210ENST00000563885 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.35■■■□□ 2.61
CENPT-210ENST00000563885 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CENPT-210ENST00000563885 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.18■■■□□ 2.58
CENPT-210ENST00000563885 WIZO95785 1651 aa31.16■■■□□ 2.58
CENPT-210ENST00000563885 SMARCA4P51532 1647 aa31.09■■■□□ 2.57
CENPT-210ENST00000563885 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.541e-6■■■□□ 18.6
CENPT-210ENST00000563885 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CENPT-210ENST00000563885 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.69■■■□□ 2.5
CENPT-210ENST00000563885 SMARCA2P51531 1590 aa30.57■■■□□ 2.48
CENPT-210ENST00000563885 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CENPT-210ENST00000563885 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.51■■■□□ 2.47
CENPT-210ENST00000563885 TRIM41Q8WV44 630 aa30.5■■■□□ 2.47
CENPT-210ENST00000563885 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.4■■■□□ 2.46
CENPT-210ENST00000563885 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CENPT-210ENST00000563885 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.17■■■□□ 2.42
CENPT-210ENST00000563885 HMGXB3Q12766 1538 aa30.09■■■□□ 2.41
CENPT-210ENST00000563885 ABCC8Q09428 1581 aa30.07■■■□□ 2.4
CENPT-210ENST00000563885 NCAPD3P42695 1498 aa30.04■■■□□ 2.4
CENPT-210ENST00000563885 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CENPT-210ENST00000563885 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
CENPT-210ENST00000563885 EEA1Q15075 1411 aa29.71■■■□□ 2.35
CENPT-210ENST00000563885 SYNJ1O43426 1573 aa29.68■■■□□ 2.34
CENPT-210ENST00000563885 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.62■■■□□ 2.33
CENPT-210ENST00000563885 SOGA1O94964 1423 aa29.6■■■□□ 2.33
CENPT-210ENST00000563885 CFTRP13569 1480 aa29.54■■■□□ 2.32
CENPT-210ENST00000563885 PRDM2Q13029 1718 aa29.53■■■□□ 2.32
CENPT-210ENST00000563885 TOP2BQ02880 1626 aa29.53■■■□□ 2.32
CENPT-210ENST00000563885 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.5■■■□□ 2.31
CENPT-210ENST00000563885 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.48■■■□□ 2.31
CENPT-210ENST00000563885 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
CENPT-210ENST00000563885 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.43■■■□□ 2.3
CENPT-210ENST00000563885 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.42■■■□□ 2.3
CENPT-210ENST00000563885 GOLGA3Q08378 1498 aa29.32■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 KIF21BO75037 1637 aa29.31■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.31■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.31■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 CUX1P39880 1505 aa29.29■■■□□ 2.28
CENPT-210ENST00000563885 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.26■■■□□ 2.27
CENPT-210ENST00000563885 CEP162Q5TB80 1403 aa29.2■■■□□ 2.27
CENPT-210ENST00000563885 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CENPT-210ENST00000563885 HRCP23327 699 aa29.05■■■□□ 2.24
CENPT-210ENST00000563885 KIF27Q86VH2 1401 aa29.01■■■□□ 2.23
CENPT-210ENST00000563885 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.01■■■□□ 2.23
CENPT-210ENST00000563885 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29■■■□□ 2.23
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CENPT-210ENST00000563885 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.96■■■□□ 2.23
CENPT-210ENST00000563885 PRXQ9BXM0 1461 aa28.95■■■□□ 2.22
CENPT-210ENST00000563885 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
CENPT-210ENST00000563885 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.88■■■□□ 2.21
CENPT-210ENST00000563885 NESP48681 1621 aa28.87■■■□□ 2.21
CENPT-210ENST00000563885 CLIP1P30622 1438 aa28.85■■■□□ 2.21
CENPT-210ENST00000563885 CUX2O14529 1486 aa28.8■■■□□ 2.2
CENPT-210ENST00000563885 TOPBP1Q92547 1522 aa28.76■■■□□ 2.19
CENPT-210ENST00000563885 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CENPT-210ENST00000563885 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.7■■■□□ 2.19
CENPT-210ENST00000563885 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.69■■■□□ 2.18
CENPT-210ENST00000563885 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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CENPT-210ENST00000563885 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.65■■■□□ 2.18
CENPT-210ENST00000563885 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CENPT-210ENST00000563885 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.59■■■□□ 2.17
CENPT-210ENST00000563885 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.59■■■□□ 2.17
CENPT-210ENST00000563885 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.55■■■□□ 2.16
CENPT-210ENST00000563885 WDR97A6NE52 1622 aa28.55■■■□□ 2.16
CENPT-210ENST00000563885 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.54■■■□□ 2.16
CENPT-210ENST00000563885 ARAP1Q96P48 1450 aa28.49■■■□□ 2.15
CENPT-210ENST00000563885 CUL7Q14999 1698 aa28.48■■■□□ 2.15
CENPT-210ENST00000563885 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
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CENPT-210ENST00000563885 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.4■■■□□ 2.14
CENPT-210ENST00000563885 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
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CENPT-210ENST00000563885 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.31■■■□□ 2.12
CENPT-210ENST00000563885 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CENPT-210ENST00000563885 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
CENPT-210ENST00000563885 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.26■■■□□ 2.12
CENPT-210ENST00000563885 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CENPT-210ENST00000563885 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPT-210ENST00000563885 WDR62O43379 1518 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPT-210ENST00000563885 PBRM1Q86U86 1689 aa28.14■■■□□ 2.09
CENPT-210ENST00000563885 MAP3K1Q13233 1512 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPT-210ENST00000563885 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.1■■■□□ 2.09
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