RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496793.1

ARRDC1-AS1-202, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,424 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.26■■■■■ 7.08
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.59■■■■■ 5.53
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NACADO15069 1562 aa49.56■■■■■ 5.52
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.52■■■■■ 5.52
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.31■■■■■ 5.48
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.09■■■■■ 5.45
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.34■■■■■ 5.33
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SCRIBQ14160 1630 aa48■■■■■ 5.28
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.99■■■■■ 5.27
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.66■■■■■ 5.22
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.12■■■■■ 5.13
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.55■■■■■ 5.04
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.26■■■■■ 5
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SMARCA4P51532 1647 aa45.95■■■■■ 4.95
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SMARCA2P51531 1590 aa45.72■■■■■ 4.91
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NCAPD3P42695 1498 aa45.72■■■■■ 4.91
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.71■■■■■ 4.91
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.65■■■■■ 4.9
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.54■■■■■ 4.88
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HMGXB3Q12766 1538 aa45.49■■■■■ 4.87
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 WIZO95785 1651 aa45.2■■■■■ 4.83
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.51■■■■■ 4.72
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NESP48681 1621 aa44.49■■■■■ 4.71
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ERCC6Q03468 1493 aa44.41■■■■■ 4.7
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.39■■■■■ 4.7
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.25■■■■■ 4.67
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.18■■■■■ 4.66
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CFTRP13569 1480 aa44.12■■■■■ 4.65
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.98■■■■■ 4.63
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CUX2O14529 1486 aa43.95■■■■■ 4.63
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.85■■■■■ 4.61
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.81■■■■■ 4.6
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PRDM2Q13029 1718 aa43.76■■■■■ 4.6
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.73■■■■■ 4.59
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 WDR62O43379 1518 aa43.57■■■■■ 4.56
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ABCC8Q09428 1581 aa43.26■■■■■ 4.52
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TOPBP1Q92547 1522 aa43.14■■■■■ 4.5
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.11■■■■■ 4.49
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 IFT140Q96RY7 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CUX1P39880 1505 aa42.8■■■■■ 4.44
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.67■■■■■ 4.42
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SOGA1O94964 1423 aa42.64■■■■■ 4.42
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.411e-6■■■■■ 58.5
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.53■■■■■ 4.4
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SYNJ1O43426 1573 aa42.52■■■■■ 4.4
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TOP2BQ02880 1626 aa42.49■■■■■ 4.39
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.47■■■■■ 4.39
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 WDR97A6NE52 1622 aa42.42■■■■■ 4.38
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.382e-6■■□□□ 13.8
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.3■■■■■ 4.36
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 GRIN2BQ13224 1484 aa42.15■■■■■ 4.34
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.15■■■■■ 4.34
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.09■■■■■ 4.33
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.03■■■■■ 4.32
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PBRM1Q86U86 1689 aa41.99■■■■■ 4.31
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FBLN2P98095 1184 aa41.95■■■■■ 4.31
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CHD1O14646 1710 aa41.91■■■■■ 4.3
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SYNJ2O15056 1496 aa41.86■■■■■ 4.29
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.82■■■■■ 4.28
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TRIM41Q8WV44 630 aa41.81■■■■■ 4.28
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 KIF27Q86VH2 1401 aa41.76■■■■■ 4.28
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.68■■■■■ 4.26
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ADAMTS12P58397 1594 aa41.68■■■■■ 4.26
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 GRIN2AQ12879 1464 aa41.58■■■■■ 4.25
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 IGF1RP08069 1367 aa41.52■■■■■ 4.24
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.49■■■■■ 4.23
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ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.47■■■■■ 4.23
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CUL7Q14999 1698 aa41.44■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ARHGEF11O15085 1522 aa41.4■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NUP160Q12769 1436 aa41.39■■■■■ 4.22
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CEP170Q5SW79 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.31■■■■■ 4.2
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.07■■■■■ 4.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SHROOM2Q13796 1616 aa41.05■■■■■ 4.16
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