RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587117.1

RND2-201, Transcript of Rho family GTPase 2, humanhuman

TSL 4

Gene RND2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2-201ENST00000587117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.46■■■■■ 8.55
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RND2-201ENST00000587117 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.78■■■■■ 6.84
RND2-201ENST00000587117 NACADO15069 1562 aa57.41■■■■■ 6.78
RND2-201ENST00000587117 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.06■■■■■ 6.72
RND2-201ENST00000587117 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.05■■■■■ 6.72
RND2-201ENST00000587117 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.02■■■■■ 6.72
RND2-201ENST00000587117 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.89■■■■■ 6.7
RND2-201ENST00000587117 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.74■■■■■ 6.67
RND2-201ENST00000587117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.67■■■■■ 6.66
RND2-201ENST00000587117 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.44■■■■■ 6.63
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RND2-201ENST00000587117 SCRIBQ14160 1630 aa55.49■■■■■ 6.47
RND2-201ENST00000587117 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.37■■■■■ 6.45
RND2-201ENST00000587117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.87■■■■■ 6.37
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RND2-201ENST00000587117 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.63■■■■■ 6.34
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RND2-201ENST00000587117 SMARCA2P51531 1590 aa52.87■■■■■ 6.05
RND2-201ENST00000587117 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.87■■■■■ 6.05
RND2-201ENST00000587117 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.69■■■■■ 6.03
RND2-201ENST00000587117 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.69■■■■■ 6.03
RND2-201ENST00000587117 HMGXB3Q12766 1538 aa52.66■■■■■ 6.02
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RND2-201ENST00000587117 CUX2O14529 1486 aa52.24■■■■■ 5.95
RND2-201ENST00000587117 NESP48681 1621 aa52.2■■■■■ 5.95
RND2-201ENST00000587117 WIZO95785 1651 aa52.1■■■■■ 5.93
RND2-201ENST00000587117 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.09■■■■■ 5.93
RND2-201ENST00000587117 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.07■■■■■ 5.93
RND2-201ENST00000587117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.8■■■■■ 5.88
RND2-201ENST00000587117 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.71■■■■■ 5.87
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RND2-201ENST00000587117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.59■■■■■ 5.85
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RND2-201ENST00000587117 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.35■■■■■ 5.81
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RND2-201ENST00000587117 CFTRP13569 1480 aa51.01■■■■■ 5.76
RND2-201ENST00000587117 WDR62O43379 1518 aa50.97■■■■■ 5.75
RND2-201ENST00000587117 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.97■■■■■ 5.75
RND2-201ENST00000587117 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.84■■■■■ 5.73
RND2-201ENST00000587117 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.8■■■■■ 5.72
RND2-201ENST00000587117 PRDM2Q13029 1718 aa50.66■■■■■ 5.7
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RND2-201ENST00000587117 TOPBP1Q92547 1522 aa49.9■■■■■ 5.58
RND2-201ENST00000587117 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.87■■■■■ 5.57
RND2-201ENST00000587117 IFT140Q96RY7 1462 aa49.82■■■■■ 5.57
RND2-201ENST00000587117 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
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RND2-201ENST00000587117 OSCARQ8IYS5 282 aa49.76■■■■■ 5.56
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RND2-201ENST00000587117 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.3■■■■■ 5.48
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RND2-201ENST00000587117 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.3■■■■■ 5.48
RND2-201ENST00000587117 SOGA1O94964 1423 aa49.25■■■■■ 5.47
RND2-201ENST00000587117 CHD1O14646 1710 aa49.2■■■■■ 5.47
RND2-201ENST00000587117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.19■■■■■ 5.47
RND2-201ENST00000587117 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.13■■■■■ 5.46
RND2-201ENST00000587117 ARHGEF11O15085 1522 aa49.12■■■■■ 5.45
RND2-201ENST00000587117 WDR97A6NE52 1622 aa49.1■■■■■ 5.45
RND2-201ENST00000587117 TOP2BQ02880 1626 aa49.06■■■■■ 5.44
RND2-201ENST00000587117 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.06■■■■■ 5.44
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RND2-201ENST00000587117 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.69■■■■■ 5.38
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RND2-201ENST00000587117 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.62■■■■■ 5.37
RND2-201ENST00000587117 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.61■■■■■ 5.37
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RND2-201ENST00000587117 SYNJ2O15056 1496 aa48.51■■■■■ 5.36
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RND2-201ENST00000587117 KIF27Q86VH2 1401 aa48.14■■■■■ 5.3
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RND2-201ENST00000587117 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
RND2-201ENST00000587117 CEP170Q5SW79 1584 aa47.96■■■■■ 5.27
RND2-201ENST00000587117 NUP160Q12769 1436 aa47.93■■■■■ 5.26
RND2-201ENST00000587117 IGF1RP08069 1367 aa47.91■■■■■ 5.26
RND2-201ENST00000587117 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.89■■■■■ 5.26
RND2-201ENST00000587117 CUL7Q14999 1698 aa47.87■■■■■ 5.25
RND2-201ENST00000587117 SHROOM2Q13796 1616 aa47.78■■■■■ 5.24
RND2-201ENST00000587117 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.63■■■■■ 5.22
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