Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.045e-13■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-8■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 24.77□□□□□ -1.651e-6■■■□□ 18.9
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-8■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.75e-8■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 TTC17-208ENST00000526774 3360 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.475e-8■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 EML6-207ENST00000491655 471 ntTSL 418.14■□□□□ 0.492e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 48.84□□□□□ -0.992e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.25□□□□□ -1.092e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.382e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-201ENST00000194672 5198 ntTSL 52.36□□□□□ -2.032e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.222e-10■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 221.52■■□□□ 1.043e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.136e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PRR5-204ENST00000403696 789 ntTSL 324.01■■□□□ 1.432e-9■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.818e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 418.89■□□□□ 0.618e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 318.54■□□□□ 0.568e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.277e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.178e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 415.22■□□□□ 0.038e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.097e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-9■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 412.11□□□□□ -0.478e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-203ENST00000502736 569 ntTSL 411.28□□□□□ -0.68e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 49.03□□□□□ -0.968e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.998e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.038e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.098e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.178e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.28e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 46.11□□□□□ -1.438e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 46.11□□□□□ -1.438e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-209ENST00000507276 584 ntTSL 45.66□□□□□ -1.58e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 45.06□□□□□ -1.68e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 44.9□□□□□ -1.638e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 44.61□□□□□ -1.678e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 RAI14-214ENST00000509247 577 ntTSL 43.59□□□□□ -1.838e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PIP4K2C-204ENST00000548264 403 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 36.82□□□□□ -1.321e-7■■■□□ 18.8
AGGF1Q8N302 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 37.89□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.056e-11■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 311.4□□□□□ -0.586e-11■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 310.4□□□□□ -0.746e-11■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-9■■■□□ 18.7
AGGF1Q8N302 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.415e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-205ENST00000504666 547 ntTSL 213.89□□□□□ -0.195e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-207ENST00000505830 496 ntTSL 213.67□□□□□ -0.225e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-209ENST00000507002 581 ntTSL 312.87□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-212ENST00000509400 547 ntTSL 411.32□□□□□ -0.65e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-210ENST00000508639 675 ntTSL 310.01□□□□□ -0.815e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 SIL1-206ENST00000505353 442 ntTSL 39.3□□□□□ -0.925e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.448e-8■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.318e-8■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-8■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 215.51■□□□□ 0.078e-8■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.438e-8■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.856e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 MAST1-207ENST00000590883 1717 ntTSL 516.29■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.166e-7■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 18.6
AGGF1Q8N302 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 18.5
AGGF1Q8N302 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■□□ 18.5
AGGF1Q8N302 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-7■■■□□ 18.5
AGGF1Q8N302 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-7■■■□□ 18.5
AGGF1Q8N302 LTBP3-210ENST00000528516 3935 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.631e-7■■■□□ 18.5
Retrieved 100 of 9,853 protein–RNA pairs in 132 ms