RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.74■■□□□ 1.87
TTC17-202ENST00000299240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.99■■□□□ 1.43
TTC17-202ENST00000299240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC17-202ENST00000299240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TTC17-202ENST00000299240 ABCC9O60706 1549 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC17-202ENST00000299240 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC17-202ENST00000299240 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TTC17-202ENST00000299240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
TTC17-202ENST00000299240 SCRIBQ14160 1630 aa21.83■■□□□ 1.09
TTC17-202ENST00000299240 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC17-202ENST00000299240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC17-202ENST00000299240 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TTC17-202ENST00000299240 NACADO15069 1562 aa21.28■■□□□ 1
TTC17-202ENST00000299240 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.28■■□□□ 1
TTC17-202ENST00000299240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.25■□□□□ 0.99
TTC17-202ENST00000299240 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC17-202ENST00000299240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
TTC17-202ENST00000299240 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC17-202ENST00000299240 TRIM41Q8WV44 630 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC17-202ENST00000299240 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.96■□□□□ 0.95
TTC17-202ENST00000299240 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.95■□□□□ 0.94
TTC17-202ENST00000299240 WIZO95785 1651 aa20.75■□□□□ 0.91
TTC17-202ENST00000299240 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
TTC17-202ENST00000299240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC17-202ENST00000299240 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.58■□□□□ 0.89
TTC17-202ENST00000299240 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TTC17-202ENST00000299240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TTC17-202ENST00000299240 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TTC17-202ENST00000299240 SMARCA4P51532 1647 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC17-202ENST00000299240 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC17-202ENST00000299240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC17-202ENST00000299240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TTC17-202ENST00000299240 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC17-202ENST00000299240 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TTC17-202ENST00000299240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC17-202ENST00000299240 ABCC8Q09428 1581 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC17-202ENST00000299240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TTC17-202ENST00000299240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
TTC17-202ENST00000299240 SMARCA2P51531 1590 aa20.1■□□□□ 0.81
TTC17-202ENST00000299240 SOGA1O94964 1423 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC17-202ENST00000299240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.98■□□□□ 0.79
TTC17-202ENST00000299240 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.98■□□□□ 0.79
TTC17-202ENST00000299240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
TTC17-202ENST00000299240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.89■□□□□ 0.78
TTC17-202ENST00000299240 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TTC17-202ENST00000299240 NCAPD3P42695 1498 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC17-202ENST00000299240 NESP48681 1621 aa19.83■□□□□ 0.77
TTC17-202ENST00000299240 P3H3Q8IVL6 736 aa19.78■□□□□ 0.76
TTC17-202ENST00000299240 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC17-202ENST00000299240 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC17-202ENST00000299240 SYNJ1O43426 1573 aa19.67■□□□□ 0.74
TTC17-202ENST00000299240 APLP2Q06481 763 aa19.64■□□□□ 0.74
TTC17-202ENST00000299240 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TTC17-202ENST00000299240 FBLN2P98095 1184 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC17-202ENST00000299240 ARID3CA6NKF2 412 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC17-202ENST00000299240 HMGXB3Q12766 1538 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 CFTRP13569 1480 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.54■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 CUX2O14529 1486 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 CEP162Q5TB80 1403 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TTC17-202ENST00000299240 ITGAEP38570 1179 aa19.52■□□□□ 0.71
TTC17-202ENST00000299240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC17-202ENST00000299240 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC17-202ENST00000299240 CUX1P39880 1505 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC17-202ENST00000299240 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TTC17-202ENST00000299240 KIF27Q86VH2 1401 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC17-202ENST00000299240 GOLGA3Q08378 1498 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC17-202ENST00000299240 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC17-202ENST00000299240 CLIP1P30622 1438 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC17-202ENST00000299240 ERCC6Q03468 1493 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC17-202ENST00000299240 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC17-202ENST00000299240 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.33■□□□□ 0.69
TTC17-202ENST00000299240 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
TTC17-202ENST00000299240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 EEA1Q15075 1411 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 HRCP23327 699 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 IGF1RP08069 1367 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 TOP2BQ02880 1626 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC17-202ENST00000299240 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.678e-7■■■□□ 15.9
TTC17-202ENST00000299240 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TTC17-202ENST00000299240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
TTC17-202ENST00000299240 TOPBP1Q92547 1522 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC17-202ENST00000299240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TTC17-202ENST00000299240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
TTC17-202ENST00000299240 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC17-202ENST00000299240 PRXQ9BXM0 1461 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC17-202ENST00000299240 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC17-202ENST00000299240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
TTC17-202ENST00000299240 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.02■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.02■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.01■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.99■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.99■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 ARAP1Q96P48 1450 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC17-202ENST00000299240 KIF21BO75037 1637 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC17-202ENST00000299240 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms