Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-226ENST00000543756 613 ntTSL 318.68■□□□□ 0.589e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■■■■□ 21.8
AARSP49588 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.479e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.479e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-218ENST00000542129 1561 ntTSL 217.81■□□□□ 0.449e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.429e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.369e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-6■■■■□ 21.8
AARSP49588 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.249e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-205ENST00000438391 1135 ntTSL 516.3■□□□□ 0.29e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-207ENST00000535317 879 ntTSL 316.12■□□□□ 0.179e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-217ENST00000540935 1210 ntTSL 216.08■□□□□ 0.169e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-206ENST00000535158 1718 ntTSL 215.48■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.099e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-227ENST00000544652 400 ntTSL 514.1□□□□□ -0.159e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-211ENST00000538345 498 ntTSL 513.23□□□□□ -0.299e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-203ENST00000415475 883 ntTSL 313.09□□□□□ -0.319e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.339e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.86□□□□□ -0.359e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-213ENST00000539049 3471 ntTSL 512.44□□□□□ -0.429e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-208ENST00000536265 3603 ntTSL 512.22□□□□□ -0.459e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.549e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.629e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-204ENST00000435753 4182 ntTSL 511.07□□□□□ -0.649e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.739e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 58.54□□□□□ -1.049e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.149e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AC116366.3-204ENST00000638504 7262 ntAPPRIS P5 TSL 57.64□□□□□ -1.199e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.88□□□□□ -1.319e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 RAD50-203ENST00000423956 2915 ntTSL 54.41□□□□□ -1.79e-8■■■■□ 21.8
AARSP49588 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 21.7
AARSP49588 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 314.94□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.41□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 527.43■■□□□ 1.984e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.594e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 21.5
AARSP49588 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.869e-7■■■■□ 21.5
AARSP49588 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 21.2
AARSP49588 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 515.9■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 21.2
AARSP49588 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 21
AARSP49588 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 524.34■■□□□ 1.495e-9■■■■□ 21
AARSP49588 CLK2-206ENST00000484699 585 ntTSL 215.22■□□□□ 0.035e-9■■■■□ 21
AARSP49588 UBR4-213ENST00000483922 543 ntTSL 514.07□□□□□ -0.165e-9■■■■□ 21
AARSP49588 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 513.37□□□□□ -0.275e-9■■■■□ 21
AARSP49588 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -15e-9■■■■□ 21
AARSP49588 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.658e-10■■■■□ 20.9
AARSP49588 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.248e-10■■■■□ 20.9
AARSP49588 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 215.63■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 20.9
AARSP49588 FSCN1-204ENST00000447103 713 ntTSL 420.86■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 FSCN1-202ENST00000405801 550 ntTSL 420.31■□□□□ 0.844e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 FSCN1-203ENST00000444748 580 ntTSL 319.88■□□□□ 0.774e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.955e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 317.92■□□□□ 0.464e-6■■■■□ 20.7
AARSP49588 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)30.65■■■□□ 2.51e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.471e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.221e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.161e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.11e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.991e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)27.51■■□□□ 1.991e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.881e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.821e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 223.79■■□□□ 1.41e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 223.58■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 323.1■■□□□ 1.291e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CCNL2-205ENST00000425598 661 ntTSL 522.69■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.946e-8■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 220.56■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 220.31■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CHMP1A-203ENST00000547614 653 ntTSL 220.27■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 519.67■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 20.6
AARSP49588 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 20.6
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 85.5 ms