RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587235.5

TCF3-210, Transcript of transcription factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene TCF3, Length 986 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3-210ENST00000587235 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.7■■■■■ 7.63
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TCF3-210ENST00000587235 NACADO15069 1562 aa52.97■■■■■ 6.07
TCF3-210ENST00000587235 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.96■■■■■ 6.07
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TCF3-210ENST00000587235 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.99■■■■■ 5.91
TCF3-210ENST00000587235 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.77■■■■■ 5.88
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TCF3-210ENST00000587235 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.98■■■■■ 5.75
TCF3-210ENST00000587235 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.44■■■■■ 5.66
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TCF3-210ENST00000587235 NCAPD3P42695 1498 aa48.94■■■■■ 5.43
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TCF3-210ENST00000587235 SMARCA2P51531 1590 aa48.68■■■■■ 5.38
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TCF3-210ENST00000587235 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.31■■■■■ 5.32
TCF3-210ENST00000587235 ERCC6Q03468 1493 aa48.21■■■■■ 5.31
TCF3-210ENST00000587235 NESP48681 1621 aa48.07■■■■■ 5.29
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TCF3-210ENST00000587235 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.73■■■■■ 5.23
TCF3-210ENST00000587235 WIZO95785 1651 aa47.73■■■■■ 5.23
TCF3-210ENST00000587235 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.52■■■■■ 5.2
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TCF3-210ENST00000587235 CFTRP13569 1480 aa46.98■■■■■ 5.11
TCF3-210ENST00000587235 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.92■■■■■ 5.1
TCF3-210ENST00000587235 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.92■■■■■ 5.1
TCF3-210ENST00000587235 WDR62O43379 1518 aa46.89■■■■■ 5.1
TCF3-210ENST00000587235 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.67■■■■■ 5.06
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TCF3-210ENST00000587235 TOPBP1Q92547 1522 aa46.06■■■■■ 4.96
TCF3-210ENST00000587235 ABCC8Q09428 1581 aa45.99■■■■■ 4.95
TCF3-210ENST00000587235 IFT140Q96RY7 1462 aa45.99■■■■■ 4.95
TCF3-210ENST00000587235 OSCARQ8IYS5 282 aa45.97■■■■■ 4.95
TCF3-210ENST00000587235 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
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TCF3-210ENST00000587235 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.36■■■■■ 4.85
TCF3-210ENST00000587235 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
TCF3-210ENST00000587235 FBLN2P98095 1184 aa45.27■■■■■ 4.84
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TCF3-210ENST00000587235 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.2■■■■■ 4.83
TCF3-210ENST00000587235 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.2■■■■■ 4.83
TCF3-210ENST00000587235 CHD1O14646 1710 aa45.18■■■■■ 4.82
TCF3-210ENST00000587235 WDR97A6NE52 1622 aa45.11■■■■■ 4.81
TCF3-210ENST00000587235 ARHGEF11O15085 1522 aa45.11■■■■■ 4.81
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TCF3-210ENST00000587235 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
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TCF3-210ENST00000587235 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.88■■■■■ 4.78
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TCF3-210ENST00000587235 SYNJ1O43426 1573 aa44.71■■■■■ 4.75
TCF3-210ENST00000587235 TOP2BQ02880 1626 aa44.7■■■■■ 4.75
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TCF3-210ENST00000587235 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.7■■■■■ 4.75
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TCF3-210ENST00000587235 CEP170Q5SW79 1584 aa44.2■■■■■ 4.67
TCF3-210ENST00000587235 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.06■■■■■ 4.64
TCF3-210ENST00000587235 SHROOM2Q13796 1616 aa43.95■■■■■ 4.63
TCF3-210ENST00000587235 KIF27Q86VH2 1401 aa43.9■■■■■ 4.62
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TCF3-210ENST00000587235 IGF1RP08069 1367 aa43.9■■■■■ 4.62
TCF3-210ENST00000587235 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
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