RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587235.5

TCF3-210, Transcript of transcription factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene TCF3, Length 986 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3-210ENST00000587235 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.7■■■■■ 7.63
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TCF3-210ENST00000587235 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.98■■■■■ 5.75
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TCF3-210ENST00000587235 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.31■■■■■ 5.32
TCF3-210ENST00000587235 ERCC6Q03468 1493 aa48.21■■■■■ 5.31
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TCF3-210ENST00000587235 WIZO95785 1651 aa47.73■■■■■ 5.23
TCF3-210ENST00000587235 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.52■■■■■ 5.2
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TCF3-210ENST00000587235 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.92■■■■■ 5.1
TCF3-210ENST00000587235 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.92■■■■■ 5.1
TCF3-210ENST00000587235 WDR62O43379 1518 aa46.89■■■■■ 5.1
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TCF3-210ENST00000587235 IFT140Q96RY7 1462 aa45.99■■■■■ 4.95
TCF3-210ENST00000587235 OSCARQ8IYS5 282 aa45.97■■■■■ 4.95
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TCF3-210ENST00000587235 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
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TCF3-210ENST00000587235 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.2■■■■■ 4.83
TCF3-210ENST00000587235 CHD1O14646 1710 aa45.18■■■■■ 4.82
TCF3-210ENST00000587235 WDR97A6NE52 1622 aa45.11■■■■■ 4.81
TCF3-210ENST00000587235 ARHGEF11O15085 1522 aa45.11■■■■■ 4.81
TCF3-210ENST00000587235 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.05■■■■■ 4.8
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TCF3-210ENST00000587235 SYNJ1O43426 1573 aa44.71■■■■■ 4.75
TCF3-210ENST00000587235 TOP2BQ02880 1626 aa44.7■■■■■ 4.75
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TCF3-210ENST00000587235 CEP170Q5SW79 1584 aa44.2■■■■■ 4.67
TCF3-210ENST00000587235 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.06■■■■■ 4.64
TCF3-210ENST00000587235 SHROOM2Q13796 1616 aa43.95■■■■■ 4.63
TCF3-210ENST00000587235 KIF27Q86VH2 1401 aa43.9■■■■■ 4.62
TCF3-210ENST00000587235 JPH4Q96JJ6 628 aa43.9■■■■■ 4.62
TCF3-210ENST00000587235 IGF1RP08069 1367 aa43.9■■■■■ 4.62
TCF3-210ENST00000587235 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
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